生信小组DAY5-JANE

数据类型

先上思维导图
思维导图

向量(vector):重要
矩阵(Matrix)
数组(Array)
数据框(Data frame):重要
List

一、向量

向量
  • 1.标量和向量的区分

元素:可为数字或字符串
数字:1,2,3
字符串:s=“abcdefghij”,则s[1]=“a”,s[10]="j"
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量
赋值:赋予这个变量一个数值(其实也不一定是数值,还可以是字符串/数据框等等)

赋值

  • 2.从向量中提取元素

(1)根据元素位置
(2)根据值的大小的

  • 根据元素位置

    下图应该说是元素,也有可能不是单纯的数值
    提取
  • 根据数值大小
    a[a %in% c(1,2,3)] :存在于向量c(1,2,5)中的元素


    2

二、数据框

1、读取本地数据

**read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) **:读取文件,分隔符为Tab,有表头
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) :把这个数据框赋给一个变量a

开始时一直报错
报错

结果是因为这个软件每次开启时要重置工作目录
重置

终于好了,还是出错了
读取数据

把数据框赋给变量a
数据框赋值

2、设置行名和列名

  • 打开本地目录
  • colnames(X) :查看列名
  • rownames(X) :查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
  • colnames(X)[1]<-"bioplanet":有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
  • X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1):最后row.names的意思是修改第一列为行名
打开目录

查看行列名

修改表头

第一列变为行名

3、数据框的导出

导出
更改后

4、变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?
学会保存和重新加载。保存的格式是RData。

  • save.image(file="bioinfoplanet.RData"):保存当前所有变量
  • save(frame1,file="frame1.RData"):保存其中一个变量
  • load("frame1.RData"):再次使用RData时的加载命令

保存当前所有变量
保存所有变量

保存其中一个变量
单个变量保存

更改后

再次使用RData时的加载命令
再次加载

5、提取元素

提取元素

6、直接使用数据框中的变量

提取某两列作散点图:


image.png

其中case和value为某列的名称

散点图
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 199,340评论 5 467
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 83,762评论 2 376
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 146,329评论 0 329
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 53,678评论 1 270
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 62,583评论 5 359
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 47,995评论 1 275
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,493评论 3 390
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,145评论 0 254
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,293评论 1 294
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,250评论 2 317
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,267评论 1 328
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 32,973评论 3 316
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,556评论 3 303
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,648评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 30,873评论 1 255
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,257评论 2 345
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 41,809评论 2 339

推荐阅读更多精彩内容