1、用wget命令下载
wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
2、安装命令
添加权限并运
chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
安装过程中,提示阅读用户许可协议,需要按“Enter”继续,并输入“yes”继续安装,
并列出conda安装的具体路径,按Enter继续。
最后询问是否初始化Miniconda3时,选“no”
3、验证conda是否安装成功
输入conda命令,如未成功输出,见下一条
conda
4、使用vim工具,编辑.bashrc文件
vim ~/.bashrc
在最下行输入miniconda3的安装目录作为环境变量,与上面保存的安装目录相同,本文是“/home/chris/miniconda3”
export PATH="/home/chris/miniconda3/bin:"$PATH
输入命令使.bashrc文件生效
source ~/.bashrc
5、输入conda命令,如正常返回,说明conda安装成功
6. bioconda设置通道
安装conda后,您将需要添加bioconda通道以及bioconda依赖的其他通道。重要的是按此顺序添加它们,以便正确设置优先级(即conda-forge是最高优先级)。
该畅达锻通道包含在尚未发现许多通用包defaults通道。
conda config --add channels defaults
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge
7.安装包admixture
现在已启用Bioconda,因此可以将bioconda通道上的所有软件包安装到当前的conda环境中:
conda install admixture
等一会按y,就可以安装成功了。
可以输入admixture
查看安装成功没有
查看admixture安装目录
which admixture
添加到环境变量
vim ~/.bashrc
按一下i
export PATH="/home/chris/bin/admixture/bin:"$PATH
Esc
:wq!
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全文参考:https://www.jianshu.com/p/e49422adea46
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