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蛋白质体外液液相分离数据库—— LLPSDB
文章信息
题目:LLPSDB: a database of proteins undergoing liquid–liquid phase separation in vitro
杂志:Nucleic Acids Research
时间:August 28, 2019
链接: DOI: 10.1093/nar/gkz778
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文章介绍:
之前分享过一篇文章 火起来的相分离是什么,
相分离/相变(Phase separation)描述的是一种细胞里不同成分间相互碰撞、融合形成液滴,从而使一些成分被包裹在液滴内,一些成分被阻隔在液滴外的现象,类似于水油相混,或者可以想象成下雨天伞上的雨滴逐渐滴落的过程。这种现象在液体之间是常见的,但是,2009年,Brangwynne和Hyman关于线虫P颗粒的研究,发现P颗粒(一种蛋白质)并非像我们通常认为的是一种固体,而是像液滴一样,相互碰撞融合,剧烈摇晃后会分散成很小的液滴,而后又很快地融合形成大液滴。之后科学家发现细胞内的许多无膜细胞器——核仁、Cajal bodies、stress granules、miRISC,及突触的细胞骨架——都是特定的蛋白质/RNA的相变。
相分离/相变(Phase separation,Phase Transition)是目前比较火的一个研究领域,已有的研究表明相分离在细胞中普遍存在,与基因组的组装、转录调控可能密切相关,相分离的失调可能是一些疾病(如神经/肌肉退行性疾病)发生的病因,相关领域的科学家也开始通过相分离这个视角重新审视相关疾病,通过干扰异常“相分离”来达到治疗相关疾病的目的。
刚刚明白过相分离是什么,这里已经有人整理出了液液相分离体外蛋白质数据库((LLPS,Liquid-liquid phase separation)—— LLPSDB