GraphFrames初探

GraphFrames基本介绍

       GraphFrames,该类库是构建在DataFrame之上,它既能利用DataFrame良好的扩展性和强大的性能,同时也为Scala、Java和Python提供了统一的图处理API。GraphX基于RDD API,不支持Python API; 但GraphFrame基于DataFrame,并且支持Python API。

       与Apache Spark的GraphX类似,GraphFrames支持多种图处理功能,但得益于DataFrame因此GraphFrames与GraphX库相比有着下面几方面的优势:

1、统一的 API: 为Python、Java和Scala三种语言提供了统一的接口,这是Python和Java首次能够使用GraphX的全部算法。

2、强大的查询功能:GraphFrames使得用户可以构建与Spark SQL以及DataFrame类似的查询语句。

3、图的存储和读取:GraphFrames与DataFrame的数据源完全兼容,支持以Parquet、JSON以及CSV等格式完成图的存储或读取。

  在GraphFrames中图的顶点(Vertex)和边(Edge)都是以DataFrame形式存储的,所以一个图的所有信息都能够完整保存。

GraphFrames与GraphX的集成

       GraphFrames可以实现与GraphX的完美集成。两者之间相互转换时不会丢失任何数据。

val graph = Graph(...)

val graphFrame =GraphFrame.fromGraphX(graph)

一、安装anaconda3

1.1、选择版本

anaconda3-5.2.0

参考:https://blog.csdn.net/yuejisuo1948/article/details/81043823

1.2、获取资源

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-5.2.0-Linux-x86_64.sh

sh Anaconda3-5.2.0-Linux-x86_64.sh

export PATH=/data/install/anaconda3/bin:$PATH

参考:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/

二、安装graphframes

2.1、下载graphframes包

官方下载地址:https://spark-packages.org/package/graphframes/graphframes,下载zip格式,上传至服务器。

2.2、在服务器上解压1中的压缩包,unzip xx.zip

将/python/graphframes文件夹拷贝到anaconda3/lib/python/site-package/路径下。

unzip graphframes-0.6.0-spark2.2-s_2.11.zip

cp -rf ./graphframes-0.6.0-spark2.2-s_2.11/python/graphframes ./anaconda3/lib/python3.6/site-packages

三、安装pyspark 

版本需要和spark版本匹配,spark2.2.0 <=> pyspark2.1.2

conda install pyspark==2.2.1

四、安装完毕

示例代码:

demo代码
交互式运行图

上图为python交互运行GraphFrameDemo代码案例;

python脚本直接执行:

cd  /data/install/jupyter_namespace/public/

/data/install/anaconda3/bin/python GraphFrameDemo.py

python 提交运行图

spark-submit提交运行

spark-submit \

--master yarn \

--deploy-mode client \

--num-executors 6 \

--driver-memory 1g \

--executor-memory 1g \

--executor-cores 1 \

GraphFrameDemo.py

spark-submit 提交运行图

五、安装启动简易juypter

启动anaconda3-5.2.0自带jupyter,linux服务器配置jupyter,然后远程使用jupyter。

5.1、 进入环境ipython, 在ipython环境下输入:

from notebook.auth import passwd

passwd()

# 输入方便你记的密码,连续输;两次..输完密码后,会输出一个字符串,形如: ’sha1:9e7a5c5e0a29:8cbdvsv2344d141c92beab1c5bc6e9avsdvdsvsv’

# 将其保存下来, 完成以上操作后,通过exit()推出ipython环境

5.2、进入到用户根目录:

cd /data/install/jupyter_namespace/public/

/data/install/anaconda3/bin/jupyter notebook --generate-config

#(命令会产生文件:/data/install/anaconda3/jupyter_namespace/public/jupyter_notebook_config.py)

5.3、编辑配置文件,编辑此文件,写入

c.NotebookApp.ip = '*' # 允许访问此服务器的 IP,星号表示任意 IP

c.NotebookApp.password = u'sha1:81c56f4992cc:c39ab21d485bb4a58f77b77eec8c022d283de286' # 之前生成的密码 hash 字串

c.NotebookApp.open_browser = False # 运行时不打开本机浏览器

c.NotebookApp.port = 8881 # 使用的端口,随意设置

c.NotebookApp.enable_mathjax = True # 启用 MathJax

c.NotebookApp.notebook_dir = '/data/install/jupyter_namespace/public'

5.4、启动服务

普通用户启动:jupyter notebook 

超级用户启动:jupyter notebook --allow-root

指定配置文件启动:

nohup /data/install/anaconda3/bin/jupyter notebook --allow-root --config jupyter_notebook_config_public.py &

5.5、远程登录使用GraphFrames


注意事项:

保证集群各机器,spark-python版本一致

export PYSPARK_DRIVER_PYTHON=/data/install/anaconda3/bin/python3

export PYSPARK_PYTHON=/data/install/anaconda3/bin/python3

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