ISCE InSAR处理软件环境配置

写在前面

ISCE官方网站：https://winsar.unavco.org/software/isce，之前只能会员单位下载和使用。目前部分开源在GitHub上https://github.com/isce-framework/isce2，不过做哨兵数据的时间序列预处理足够了。这里记录和分享自己的环境配置过程，水平有限，不妥之处欢迎指正，共同进步。

系统环境

操作系统：Ubtuntu 16.04

Python环境：系统自带2.7、3.5，自己配置的Anconda3.6 Linux 64

ISCE环境：2.3.1

环境配置

Python环境

ISCE是基于Python环境运行的，所以把系统的Python环境理顺是第一步。

这里选取Anconda作为Python环境，按照github上的说明，使用canda安装依赖环境

这里注意：上面requirements.txt最后一行，把opencv改成opencv3，因为这后期处理的时候，会有导入库的错误，我重新安装了opencv3解决了问题

ISCE建议的Python是Python3,.6，所有ISCE的处理脚本的第一行都有写Python解释器的地址，如下所示：

系统默认的Python3的地址是指向Python3.5的，这里我们希望使用的是Anconda下的Python，需要以下操作

1.将usr/bin下的Python3重命名为Python3.5

2.新建快捷方式将Python3指向Anaconda的安装地址，在/usr/bin下运行(我的Anconda安装在/root/anconda3下)

ln -s /root/anconda3/bin/python /usr/bin/python3

3.链接完成后由于系统Termianl使用的是自带的Python3.5环境，因此会出错打不开。这时，按crtl+alt+f1进入控制端，输入root 和密码，可以看到报错，找到报错出现的文件，可以看到Python解释器为usr/bin/python3，把它改成python3.5(和第一步对应)，这样系统就能找到自带的Python了。总共需要修改4个或5个文件，耐心改到不报错为止。

到这里Python环境就配置好了，下一步开始编译

编译ISCE

首先，装好官方说明里面要求的各类编译器g++等等。

在terminal设置一个临时的环境变量，把Pythonpath临时性的指向isce2软件下configuration所在的位置，我这里是

export PYTHONPATH = /usr/local/isce2/configuration

然后安装各种依赖环境

apt install -y gfortran libmotif-dev libhdf5-dev libfftw3-dev libgdal-dev scons python3 cython3 python3-scipy python3-matplotlib python3-h5py python3-gdal python3-pip wget curl gdal-bin

按照官方说明，在/usr/local/isce2文件夹下新建一个SConfigISCE文件，并按要求填入对应信息，这里给出我填的作为参考，我没有使用GPU加速，所以去掉了最后两行。

PRJ_SCONS_BUILD = /usr/local/isce2/build

PRJ_SCONS_INSTALL = /usr/local/isce2/install/isce2

LIBPATH = /usr/lib/x86_64-linux-gnu /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial

CPPPATH = /root/anaconda3/include/python3.6m /usr/include/x86_64-linux-gnu /usr/include /usr/include/hdf5/serial /usr/include/gdal

FORTRANPATH = /usr/include /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/5.4.0/include

FORTRAN = /usr/bin/gfortran

CC = /usr/bin/gcc

CXX = /usr/bin/g++

MOTIFLIBPATH = /usr/lib/x86_64-linux-gnu

X11LIBPATH = /usr/lib/x86_64-linux-gnu

MOTIFINCPATH = /usr/include/Xm

X11INCPATH = /usr/local/include

ENABLE_CUDA = False

然后运行

scons install

编译完成之后，install中会多很多文件，下一步设置好环境变量，就能使用了

环境变量设置

terminal输入gedit ~/.bashrc

加入如下信息：

export ISCE_ROOT=/usr/local/isce2/install

export ISCE_HOME=/usr/local/isce2/isce

export PATH=$ISCE_HOME/bin:$ISCE_HOME/applications:$PATHENV

export PYTHONPATH=$ISCE_ROOT:$ISCE_HOME/applications:$ISCE_HOME/component

然后source ~/.bashrc 使环境变量生效

总结

在Terminal输入Python3，进入Python界面，输入

import isce

如果不报错，说明就安装完成啦，enjoy it。

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