用bedtools的getfasta功能
官网介绍在此getfasta — bedtools 2.31.0 documentation 写的蛮清楚的
上传的bed文件带上name一列,比较方便后续分析的区分
其中-fi 为索引文件,注意需要有.fai 文件在同一个目录下,
bedtools getfasta -fi test.fa -bed test.bed -name
用bedtools的getfasta功能
官网介绍在此getfasta — bedtools 2.31.0 documentation 写的蛮清楚的
上传的bed文件带上name一列,比较方便后续分析的区分
其中-fi 为索引文件,注意需要有.fai 文件在同一个目录下,
bedtools getfasta -fi test.fa -bed test.bed -name