并非所有的道路从此就十分平顺,丁汝昌很快就遭遇了仕途上最大的坎坷:1874年,刘铭传收到朝廷“裁军节饷”的旨意,于是他准备裁撤丁汝昌所在的马队三营。可是,命令传达下去之后,丁汝昌却拒绝执行。刘铭传大怒,想按军法处决丁汝昌。丁汝昌一见势头不好,连忙逃回家乡避难,从此和刘铭传分道扬镳。
罢职回乡,丁汝昌只能靠家里的数亩薄田度日,虽然温饱没有问题,但是这种生活对于经历过戎马生涯和仕途荣光的丁汝昌来说,显然并不能让他称心如意。也恰恰是在这一时期,清朝廷开始筹备海防事宜,直隶总督兼北洋通商大臣李鸿章奉命督办。
丁汝昌之前曾经做过李鸿章的下属,他听到李鸿章督办北洋海防事务之后,特意前去投奔。