DAP-seq技术在研究谷氧还蛋白MeGRXC3调控木薯响应干旱胁迫分子机制中的应用

木薯(Manihot esculenta Crantz)是一种重要的热带作物,是热带和亚热带干旱地区的主要粮食作物之一。干旱胁迫严重影响木薯的产量和品质。鉴定木薯中重要的抗旱基因,对于培育抗旱高产木薯新品种具有非常重要的意义。

2022年9月1日,中国热带农业科学院热带生物技术研究所功能基因研究组的最新研究成果,在知名学术期刊Plant Biotechnology Journal上发表,文章题目为 “A CC-type glutaredoxin, MeGRXC3, associates with catalases and negatively regulates drought tolerance in cassava (Manihot esculenta Crantz)”。该期刊的影响因子为13.263。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq) 技术鉴定了木薯中转录因子MeTGA2的结合基序、预测了其靶点。进一步研究揭示了MeGRXC3调控过氧化氢酶活性响应植物干旱胁迫的分子机制,为利用基因工程策略开发抗旱高产木薯新品种提供了宝贵的基因资源。

谷氧还蛋白(GRXs)在植物响应环境变化的活性氧(ROS)稳态中发挥至关重要的作用。研究人员在木薯中发现了几种对干旱敏感的CC型GRXs。然而,CC型GRXs如何调控干旱胁迫下木薯的ROS稳态尚不清楚。该研究对MeGRXC3基因参与木薯ROS信号转导和干旱胁迫响应的分子机制进行了深入的探究。

该团队通过目标区间重测序和抗旱指标的关联分析,确定了MeGRXC3与干旱胁迫下木薯叶片中的过氧化氢酶活性显著相关。通过抗旱表型分析,发现MeGRXC3负调控干旱和脱落酸诱导的气孔关闭,从而影响转基因木薯的干旱耐受性。进一步分析发现,MeGRXC3可以拮抗性调控过氧化氢在木薯叶片表皮细胞和保卫细胞中的分布。

图1. MeGRXC3与转录因子MeTGA2在细胞核中相互作用

(a) 酵母双杂交实验表明MeGRXC3与MeTGA2相互作用。(b) 双分子荧光互补实验表明在烟叶中MeGRXC3与MeTGA2可以在体内相互作用。(c) 在酵母中MeTGA2具有转录激活活性。(d) DAP-seq鉴定了木薯MeTGA2结合的motif。(e) 基于DAP-seq分析,鉴定了木薯中MeTGA2的靶点基因。

通过蛋白免疫共沉淀技术从木薯叶片中筛选到3个可能与MeGRXC3互作的过氧化氢酶蛋白,随后证实了MeGRXC3可以分别与过氧化氢酶MeCAT1、MeCAT2相互结合,并调控其过氧化氢酶活性。此外,研究团队发现MeGRXC3可以通过与转录因子MeTGA2互作来调控多个胁迫相关转录因子基因的表达,并通过转录因子MeMYB63调控过氧化氢酶MeCAT7基因的表达,从而在转录水平上调控过氧化氢酶的活性。以上研究揭示了MeGRXC3通过活性氧平衡调控植物干旱胁迫响应的分子机制,同时展现了MeGRXC3基因在提升干旱环境下木薯块根产量方面的潜在应用价值。

图2. MeGRXC3调控过氧化氢酶响应干旱胁迫的作用模式

该研究揭示了CC型谷氧还蛋白MeGRXC3在转录水平及转录后水平调控过氧化氢酶的活性,影响过氧化氢在叶片表皮不同类型细胞中的分布,从而调控木薯对干旱胁迫的响应。该研究结果有助于理解谷氧还蛋白GRXs通过活性氧平衡调控木薯干旱胁迫响应的复杂机制,同时为利用MeGRXC3基因培育抗旱高产木薯新品种提供了一种新策略。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 199,711评论 5 468
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 83,932评论 2 376
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 146,770评论 0 330
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 53,799评论 1 271
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 62,697评论 5 359
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,069评论 1 276
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,535评论 3 390
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,200评论 0 254
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,353评论 1 294
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,290评论 2 317
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,331评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,020评论 3 315
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,610评论 3 303
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,694评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 30,927评论 1 255
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,330评论 2 346
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 41,904评论 2 341

推荐阅读更多精彩内容