conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
确认已经安装好了miniconda3,然后按照上述代码设置好使用清华的镜像（以后安装软件比较快速方便）。然后就可以按照流程创建环境和安装软件了
conda create -n wes python=2.7
conda install sra-tools
conda install samtools
还可以批量安装（-y是为了省略安装中间的询问）
conda install -y sambamba samblaster snpEFF bcftools multiqc fastqc qualimap
gatk4的安装目前conda装不了4.0版本以上的，可官网下载安装
这里我下载的是4.1.8.0版本https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.1.8.0/gatk-4.1.8.0.zip
下载完，解压缩即可。下载以及解压代码如下：
mkdir gatk4 && cd gatk4
wget https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.1.8.0/gatk-4.1.8.0.zip
unzip gatk-4.1.8.0.zip
gatk只是一个软件而已，安装也很简单，但是使用的话还需要下载100多个G的必备数据
下载方式是官网，但通过ftp匿名登录下载:
主机: ftp.broadinstitute.org/bundle
username: gsapubftp-anonymous
password:
