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编译安装至用户指定目录。
升级make
wget http://ftp.gnu.org/gnu/make/make-4.2.1.tar.gz
tar -zxvf make-4.2.1.tar.gz
cd make-4.2.1
./configure --prefix=$HOME/dirname/make-4.2.1
make && make install
make
可执行文件位于dirname/make-4.2.1/bin目录中,添加该目录至PATH
环境变量。
gcc
wget http://ftp.gnu.org/gnu/gcc/gcc-7.3.0/gcc-7.3.0.tar.gz
tar -zxvf gcc-7.3.0.tar.gz
cd gcc-7.3.0
./contrib/download_prerequisites
./configure --prefix=$HOME/dirname/gcc-7.3.0 --disable-multilib
make -j 8 && make install
./contrib/download_prerequisites
这步命令需联网下载gmp-6.1.0.tar.bz2
、mpfr-3.1.4.tar.bz2
、mpc-1.0.3.tar.gz
和isl-0.16.1.tar.bz2
四个文件,服务器联网方法可见服务器SSH隧道联网设置,也可在ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/infrastructure地址下载,上传至gcc-7.3.0目录执行编译安装。make -j 8
为开启8线程加快编译进程,编译完成后添加dirname/gcc-7.3.0/bin至PATH
环境变量,dirname/gcc-7.3.0/lib64至LD_LIBRARY_PATH
。
openmpi
wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v3.1/openmpi-3.1.2.tar.gz
tar -zxvf openmpi-3.1.2.tar.gz
cd openmpi-3.1.2
./configure --prefix=$HOME/dirname/openmpi-3.1.2
make -j 8 && make install
编译完成后添加dirname/openmpi-3.1.2/bin目录至PATH
环境变量,dirname/openmpi-3.1.2/lib目录至LD_LIBRARY_PATH
。
lapack
wget https://github.com/Reference-LAPACK/lapack/archive/v3.9.0.tar.gz
tar -zxvf lapack-3.9.0.tar.gz
cd lapack-3.9.0
cp INSTALL/make.inc.gfortran ./make.inc
make.inc
文件中FFLAGS = -O2 -frecursive
改为FFLAGS = -O2 -frecursive -fPIC -m64
,FFLAGS_NOOPT = -O0 -frecursive
改为FFLAGS_NOOPT = -O0 -frecursive -fPIC -m64
,BLASLIB = $(TOPSRCDIR)/librefblas.a
改为BLASLIB = $(TOPSRCDIR)/libblas.a
。执行make lapack_install lib blaslib
编译,在目录下得到libblas.a liblapack.a libtmglib.a
库文件。再将这三个文件复制或ln -s
链接至所需位置。
scalapack
wget http://www.netlib.org/scalapack/scalapack-2.1.0.tgz
tar -zxvf scalapack-2.1.0.tgz
cd scalapack-2.1.0
cp SLmake.inc.example SLmake.inc
修改SLmake.inc
文件中的下述内容,-lblas
和-llapack
指libblas.a
和liblapack.a
文件。
FC = mpifort
CC = mpifort
NOOPT = -O0 -fPIC
FCFLAGS = -O3 -fPIC
CCFLAGS = -O3 -fPIC
CFLAGS = -O3 -fPIC
BLASLIB = -L/dirname/lib -lblas
LAPACKLIB = -L/dirname/lib -llapack
执行如下命令后make
,得到libscalapack.a
库文件,再将libscalapack.a
复制或链接至所需位置。
sed -i '0,/int n/! s/int n/int long n/' REDIST/SRC/pgemraux.c
sed -i 's|MPI_Comm_create(tcomm, tgrp|MPI_Comm_create_group(tcomm, tgrp, 0|g' BLACS/SRC/blacs_map_.c
sed -i 's|MPI_Comm_create(ucomm, bgrp|MPI_Comm_create_group(ucomm, bgrp, 0|g' BLACS/SRC/BI_TransUserComm.c