Day-3 lzyazcr
今天的的任务是下载软件~
确定系统位数
unmae -a
打开服务器目录
cd -/new
下载成功
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sh=Windows的exe
安装程序
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
激活软件
source ~/.bashrc
添加镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
教程实在太详细了~
软件使用
查看软件列表
conda list###查看软件列表
搜索软件
conda search fastqc
安装(不加-Y安装中需要自己输入一些指令)
conda install fastqc -y
卸载
conda remove fastqc
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conda环境
查看当前conda环境
conda info --envs
建立新环境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic
环境的激活~~
conda activate rna-seq