并行处理InSAR数据的简便方案

写在前面

InSAR数据处理,包含大量的计算工作,尤其现在一景数据,动辄4、5个GB,再加上配准、干涉中间数据处理过程多,一块区域处理一个星期都有可能,就别提返工了,个把月就过去了。

以SBAS-InSAR数据处理为例,多期数据可能产生数百个干涉对,这些个干涉对,如果逐个进行干涉、解缠计算,运算量极大。

在计算机性能允许的情况下,如果能同时并行处理多个干涉对,可以大大提高干涉效率。

下文就举一个GMTSAR并行解缠的例子。

软件环境配置

计算机环境:Ubtuntu18

InSAR处理软件:GMTSAR 5.4

并行数据处理依赖于一个第三方的软件叫parallel 

使用命令  apt-get install parallel 安装,一个命令就搞定。

配置处理命令

这里以GMTSAR的解缠命令为例,进行配置。

假设我们要解缠6个干涉对,所在绝对路径是:

/home/gmtsar/cl/intf_all/2015329_2015353

/home/gmtsar/cl/intf_all/2015329_2016012

/home/gmtsar/cl/intf_all/2015329_2016036

/home/gmtsar/cl/intf_all/2015329_2016060

/home/gmtsar/cl/intf_all/2015329_2016108

/home/gmtsar/cl/intf_all/2015329_2016132

GMTSAR使用snaphu_interp.csh命令进行解缠,需要做两步动作

1.进入干涉文件夹;2.使用snaphu_interp.csh脚本进行解缠。

我们要做6次解缠操作,就写6个独立的数据脚本:

第一个:

#!/bin/csh -f

cd /home/gmtsar/cl/intf_all/2015329_2015353

ln -s ../mask_def.grd .

snaphu_interp.csh 0.001 0

命名为1.csh

第二个:

#!/bin/csh -f

cd /home/gmtsar/cl/intf_all/2015329_2016012

ln -s ../mask_def.grd .

snaphu_interp.csh 0.001 0

命名为2.csh

以此类推,写完全部处理脚本(你可以用任何用顺手的方式批量写,我用的python)

这样我们就得到了全部处理脚本1.csh、2.csh、3.csh、4.csh、5.csh、6.csh

最后,写一个总脚本,逐行把单个脚本的执行命令逐行写进去,类似这样

./1.csh

./2.csh

./3.csh

./4.csh

./5.csh

./6.csh

命名为batchUnwrap.csh

这里就能做并行解缠了

命令为 parallel --jobs 6 < batchUnwrap.csh

这里的6是并行数,也就是6个一起算,大家可以根据机器性能自己尝试。

最后

parallel是一个第三方的软件,也就是你可以用他并行处理其他软件的任务,不论GMRSAR,还是ISCE,还是GAMMA,都一样。所以超好用!!

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 202,802评论 5 476
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 85,109评论 2 379
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 149,683评论 0 335
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,458评论 1 273
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,452评论 5 364
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,505评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,901评论 3 395
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,550评论 0 256
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,763评论 1 296
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,556评论 2 319
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,629评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,330评论 4 318
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,898评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,897评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,140评论 1 259
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,807评论 2 349
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,339评论 2 342

推荐阅读更多精彩内容