Pajek的数据格式转化和主要操作汇总

一、文献题录数据格式转换

来自数据库的数据文献转换。使用VOSviewer可以读取大部分的数据库的题录文献。
VOSviewer支持数据格式如下:


数据格式

在选择自己所需的节点,生成可视化图谱后,点击file面板>save>pajek即可保存net\pattition\vector文件。

保存界面

二、矩阵数据转换

部分研究由于是多个数据库数据合并或采用了网络数据,因此使用编程语言或矩阵构建工具(如bicomb)构建了共现矩阵,该转化可以通过通过文章《excel矩阵如何转化为pajek的net文件》构建net标准文件。
1.准备一个矩阵,这个矩阵可以是多值矩阵也可以是二值矩阵。
2.删除原始矩阵的行标签和列表签,添加定点标签和矩阵标签(注意:此时execl中不能有空格)

矩阵

3、execl文件保存成txt格式的文件,并使用ASCII编码。
保存

4、把上一步骤保存的txt文件的后缀名改为net,并双击打开。在Pajek中保存为标准文件。
更改

打开

标准保存

5、打开标准的net文件进行查看。把这个标准net文件的后缀改为csv风格,在excel表中实现替换。

查看
替换
替换后

生成的文件可以转化为map和network文件导入VOSviewer进行分析,也可以在Pajek中显示节点label。

pajek的主要操作快捷汇总

集聚系数: Pajek4.03版本(http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/) Network>Create Vector>Clustering Coefficient>CC1 Watts-Strogatz Clustering Coefficient (感觉像是基于小世界网络算出来的系数) Network Clustering Coefficient (Transitivity)

直径、两点之间最短距离、测地线(捷径): Pajek4.03版本(http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/) Network>Create New Network>SubNetwork with paths> 分别是两点之间最短距离 多有点对之间最短距离 限定步长的两点之间最短距离 测地线 网络的直径

参考资料:
《excel矩阵如何转化为pajek的net文件》
Pajek计算常用值(直径、平均路径、集聚系数

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