FISH,即Fluorescence in situ hybridization,是RNA和DNA可视化的关键技术,而针对RNA和DNA的特异性探针设计又是关键中的关键。今天分析的是一篇Nature Method的研究,他们开发了一个用于针对全基因组,转录组亦或单个基因座位的FISH探针设计工具,可以进行在线的FISH探针设计—— PaintSHOP。
Reference
Hershberg, E. A. et al. PaintSHOP enables the interactive design of transcriptome- and genome-scale oligonucleotide FISH experiments. Nat Methods (2021).