1、4倍简并位点（fourfold degenerate site）
（1）如果密码子的某个位点上任何核苷酸都编码同样的氨基酸，则称这个位点为4倍简并位点。
（2）例如甘氨酸密码子（GGA, GGG, GGC, GGU）的第三个位点就是一个4倍简并位点，因为这个位点上所有的核苷酸替换（无论是A、G、U、C）都是同义的，即编码同一个氨基酸。
2、4DTV的定义
The 4DTv is calculated as the number of transversions at all four fold degenerate third codon positions divided by the number of fourfold degenerate third codon positions.
简单理解就是，4倍简并位点第三个核酸密码子的替换率。
image.png
3、4DTV的生物学意义
共线性区段所包含的基因对的4DTV值可反映物种在进化史中的物种相对分化事件以及全基因组复制事件。
image.png
其实，我的理解是，较多的基因对数存在4倍简并位点，说明基因组多样性较多，或者说冗余基因较多，可能此刻发生了物种分化或者基因组复制。简单理解，这是一个变化巨大的过程。如果4倍简并位点替换率较低，或者说达到一个平稳状态，那么可能这个物种，并没有重大事件发生，一直平衡发展。
深入理解，还要结合文献，这里只是科普下。
