文献信息:
标题:Functional and Genomic Variation between Human-Derived Isolates of Lachnospiraceae Reveals Inter- and Intra-Species Diversity
中文:人源Lachnospiraceae分离株之间的功能和基因组变异揭示了种间和种内多样性
杂志:cell host and microbe
时间:2020
摘要:
属于钩端螺旋体科的细菌在健康人类中是微生物群落中丰富的专性厌氧成员。拉氏螺菌科通过产生短链脂肪酸,将伯胆汁酸转化为仲胆汁酸并促进对肠道病原体的定植抗性来影响宿主。为了增进我们对该家族成员之间基因组和功能多样性的了解,我们培养了代表人类供体的11个属和27个物种的273漆单藻科分离株,并进行了全基因组测序组装和注释。这项分析表明,物种间和物种间的途径存在很大差异,这很可能会影响菌株对寄主健康的影响。这些差异可能会通过羊毛硫抗生素表达或肠道酸化影响定居抗性,可能通过丁酸产生影响宿主粘膜免疫细胞和肠上皮细胞,或者通过异质多糖代谢促进财团内部的协同作用。这些特定功能的鉴定可以促进益生菌菌群的发展,所述益生菌菌群驱动和/或恢复体内微生物组功能。
人体共生菌相对丰度
Lachnospiraceae分离株系统发生
核心基因比较分析多样性