终于，孙中山下定决心镇压商团叛乱。当夜，成立了以孙中山为首的革命委员会，作为镇压叛乱的权力机关。廖仲恺、蒋介石等6人担任委员，鲍罗廷为顾问。
第二天，孙中山调参加北伐的警卫军及湘、粤军各一部从韶关连夜回师广州戡乱。孙中山下达平定商团手令，规定在平定商团期内，黄埔军校、工团军、农民自卫军、警卫军等部队，统归蒋介石指挥。
日暮，黄埔军校一期学生400多人全副武装由黄埔开赴广州。军校函知市警察局：军校学生夜间演习，转知市民毋得惊慌。
大雨如注，荷枪实弹的黄埔生排着整齐的队伍，静静地走在永汉路上。脚下，一片片水花。
夜幕下，黄埔生完成了对商团军的包围，大雨停止。深夜，口头宣布命令：围剿商团叛乱。
何应钦一声令下，平叛战斗终于打响！黄埔生的机枪向商团军的阵地扫射着，清脆的枪声打破了城市雨后的寂静。商团军有钱心无勇气，更无斗志。枪声中，奸诈本性毕露，吓唬商人的枪弹成了累赘。很快，黄埔生占领了商团军的总部，广州市区的商团军全部被肃清。陈廉伯急调佛山、虎门的兵力，企图偷袭黄埔岛。
千余商团军兵临黄埔岛，岛上留守学生早已进入环岛工事。陈廉伯偷袭不成，也不敢强攻，急急忙忙把队伍交给副手，自己跑到香港去了。
平定商团的战斗胜利结束，黄埔军校缴获了枪支弹药，军校学生得到了战斗锻炼。
