美国北加州郊区漆黑的夜里，一颗植物前出现了长长的不同于人类的手指，伴随着怪异的发音，植物被拔了出来。
随之而来人类追赶的声音，飞船慌忙离去，E.T.外星人被同伴不小心留在了地球上。艾里奥特和小E.T.童真的另类友谊随之展开。
E.T.长着海龟一样的肚子，弹簧一样的脖子，爱因斯坦式的眼睛，走路迈着鸭子步。
虽然语言上E.T.和艾略特无法沟通，但是他们的感情却跨越了一切外在的障碍而联系在一起。虽然他们的外型有如此大的差异，但却都有着一颗善良敏感、渴望着爱和呵护的童心。
艾略特兄妹三个和离异的母亲住在一起，由于工作忙碌加上心情糟糕，母亲时常会忽视对孩子们的关爱和沟通。
在艾略特和E.T.之间，建立起一种奇妙的心灵感应，E.T.难过的时候，艾略特也会感觉忧郁，E.T.病了，艾里奥特也会跟着不舒服。孤独的E.T.和孤独的艾略特成为了最好的朋友，于是他们都不再孤独。
学会简单的对话后，E.T.要回到外星球，回到他的家园。
万圣节时，艾略特和哥哥、妹妹将E.T.化好妆带出了家，去了外面的森林，通过建立的通讯设施和外星球取得联系。
一个晚上过去后，意外发生了。艾略特和被哥哥找回家的E.T.同时生命垂危，此时家里被身穿宇航服的工作人包围。
医护人员开始治疗，经过化验发现E.T.蛋白质与人类不同，和艾略特脑电波同步。
不幸的是二者体温持续下降，血压下降，生命迹象减弱。艾略特的情况突然稳定了，E.T.却快要死了，被装入了冰袋。
对外星人感兴趣的工作人员善意的让艾略特与E.T.独处了一会。艾略特突然发现妹妹送给E.T.的那盆花又奇迹般恢复了生机，他匆匆忙忙打开了冰袋，发现E.T.的心脏又发出了橘红色的光芒，E.T.复活了，外星球和E.T.取得了联系。
艾略特和哥哥还有小伙伴们，避开了工作人员的追赶，带着E.T.赶往森林。一群小男孩，骑着自行车，在山坡上跳跃，像勇敢的飞燕。
火红的夕阳下，E.T.用意念让男孩们骑着自行车飞了起来，成功地找到森林里建立的通讯基地，外星球的飞船已经降落等待。
E.T.跟大家告别，对妹妹说：乖乖的。对哥哥说了谢谢。艾略特缓慢走到E.T.面前，ET对艾略特说：“跟我走。”艾略特对ET说：“留下来。”他们手指相对，然后紧紧拥抱，艾略特的眼泪流了出来。ET用发光的手指指指艾略特的脑门，说：“我永远在这里。”
终于E.T.抱起了妹妹送给他的一盆花，茂盛的花和他的身影走上斜梯，消失在一片光芒中，飞船缓慢上升，突然飞船在高空停滞一下，化作更亮的光点，飞速向宇宙飞去，只留下一道划破天际的彩虹，映衬着暗蓝色的天空……
