- Huang M, Chen L yun, Chen Z qiang. Diallel analysis of combining ability and heterosis for yield and yield components in rice by using positive loci. Euphytica. 2015;205:37–50.
双列杂交已广泛用于一般组合能力（GCA），特异性组合能力（SCA）和杂种优势的分析。在本研究中，从国际水稻研究所饲养的60个近交稻中选择12个品系，根据前三个产量试验实验的连续三个季节，选择具有极高或低产量记录的近交稻，构建半双列交配。由12条线的分子标记显示的遗传距离（GD）范围为0.2288-0.7169，平均为0.5882;聚类分析显示，12个品系被分成4组，保持60个品系的原始簇结构。筛选包括有效增加基因座（ILs）和有效降低基因座（DLs）的阳性基因座（PLs）。结果表明，来自具有较高GCA效应的亲本的杂交体对产量和产量组分的性状具有更好的性能。 SCA效应与F 1 1性能以及杂种优势密切相关;基于IL的GD与产量和产量组分的SCA效应和杂种优势显着正相关，而基于DL的GD显示显着的负相关。基于这项研究，构想了一个新的概念，即组合能力（GSCA）的一般总和，其被定义为混合物的两个亲本的GCA之和。 GSCA和SCA显示与产量和产量组分的性状类似的相关性。结果表明，ILs可用于进一步研究产量和产量组分性状杂种优势的预测;和GSCA可能是另一个相当大的参数与ILs结合为育种者选择精英杂交。
杂种优势的利用已经成为提高植物，特别是在水稻中的生产力的主要策略，以用不断减少的耕地种植不断增加的人口（Masood等人2005）。自Schnell等人1982）指出杂种优势是所有育种类别（除了品系育种之外）的主要产量因子以来，已经有许多关于杂种优势的报道。F1杂种的产量组分通常用于探索水稻产量杂种优势的估计和预测方法（Xangsayasaneet al。2010; Melchinger et al。2008; Gartner et al。2009; Cho et al。2004）。通常进行全双列或不完全双列交配来定义杂种优势和异质性（Zhang等人1994; Torres和Geraldi，2007）。杂种优势水平显然是用于后代生产的两个亲本的组合的函数，可能对植物育种者造成重大挑战，因为通常必须测试数千个亲本组合以鉴定最佳组合（Gartner等人2009; Umakanta 2002）。
基于选择杂种的育种策略需要决于亲本选择的预期杂种优势水平，特殊配合力（SCA），F1杂种的表现。但是如何选择能够产生杂种优势组合的亲本系，而不必对亲本之间所有可能的组合进行杂交？有几种方法尝试后获得不同程度的成功，包括：本身的表现、通过地理起源确定的遗传多样性、使用形态学和农艺性状的多性状分析，同工酶和分子多态性，配合力，线粒体互补等。在这些方法，本身的表现是基于这样的假设，一般来说，高产亲本比低产亲本产生更高比例的高产杂种（Mohammadi etal。2008）。在Melo等人（2001）的研究中，涉及不同来源的十个商业单交杂种，在本身的性能和SCA之间，以及在本身的性能和杂种优势之间检测到强烈的相关性。然而，SCA和遗传距离之间的相关性不显着。
分子标记已经用于水稻发现生态型或亚种和杂种亲本的遗传关系（Xangsayasane et al。2010; Xiao et al。1996; Xu et al。2002）。遗传多样性的评估在植物育种中是重要的，基于分子标记的遗传多样性分析（MMGDA）具有评估遗传多样性随时间和空间变化的潜力（Duwvick 1984），并且对MMGDA的研究也是巨大的并且反映了在水稻中的潜在应用（Ravi et al.2003; Xu et al.2002），发现基于分子标记的遗传距离和杂交表现之间的关系较差（Hua等人，2002）。然而，Xie et al。 （2013）利用207个SSR标记定义了来自国际水稻研究所（IRRI）的168个热带indica杂种水稻种质的杂种群体，结果得到了菲律宾发布的11种IRRI饲养的商业杂种的支持，表明父母组首先由分子标记形成，关联和预测可以得到增强。本研究的目的是（1）评价由分子标记和产量表现分组的品系间产量杂种优势的大小; （2）检查基于标记物的组与产量性能之间的一致性; （3）分析所选择品系及其杂种的产量和产量组分的配合力效应;和（4）阐明利用包括有效增加基因座（IL）和有效降低基因座（DL）的阳性基因座（PL）来预测产量和产量组分的杂种优势。
