在linux服务器上使用R语言及Rstudio server
1. R 获取
官网：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/index.html
根据需求下载相应版本链接，使用wget获取
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.6.3.tar.gz
2. 解压：
tar -zvxf R-3.6.3.tar.gz
cd R-3.6.3
3.设置配置文件
./configure --enable-R-shlib --with-readline=yes --with-libpng=yes --with-blas --prefix=home/xxx/
#非root用户安装时 需要利用--prefix参数安装到自己指定目录下，防止报错
必加参数'--enable-R-shlib' 参数，否则再之后安装R-studio-server时会出现 找不到"lib.so"文件的错误。
–enable-R-shlib表示生成libR.so库，这个当需要进行gcc等编译的时候很重要
–with-readline=yes表示用于R shell条件下的调试优化，建议加上
–with-libpng=yes表示可导出png图片
–with-blas表示优化R运算并生成libRblas.so库
–prefix保证最后能完整安装，否则make install会去安装到/usr/lib文件夹下，非root用户没有权限
4. 根据错误提示，安装其他必要程序,比如
yum search libcurl ## 查看镜像服务器有没有“libcurl”程序，有的的话直接用`yum install `命令安装
yum install libcurl-devel ## 安装libcurl程序
yum install readline-devel ## 安装readline程序
yum install bzip2-devel ## 安装bzip2程序
yum install libXt.x86_64 libXt-devel.x86_64 libXtst.x86_64 libXtst-devel.x86_64 libX11.x86_64 ## 安装X11
yum install java ##安装Java
5.安装
make -j4 ##可以加快编译
make install
安装成功！
R #在命令行直接输入“R”即可进入R 编辑。
q() ##退出R编辑
6.安装R-studio-server
官网：RStudio | Open source & professional software for data science teams - RStudio
选择Rstudio Server
选择系统对应版本
安装
wget https://download2.rstudio.org/server/centos7/x86_64/rstudio-server-rhel-2021.09.1-372-x86_64.rpm
sudo yum install rstudio-server-rhel-2021.09.1-372-x86_64.rpm
Rstudio Server的主要命令
rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安装错误
rstudio-server start ##启动 rstudio
rstudio-server stop ## 关闭rstudio
rstudio-server status ## 查看rstudio 运行状态
运行rstudio-server status出现 “Active: active (running) ” 表示rstudio 已启动
rstudio-server restart ##重启
网络设置
#添加8787端口，Rstudio默认是8787端口：
firewall-cmd --zone=public --add-port=8787/tcp --permanent
##（–permanent永久生效，没有此参数重启后失效）
#重新载入防火墙：
firewall-cmd --reload
#查看：
firewall-cmd --zone=public --query-port=8787/tcp
#删除：
firewall-cmd --zone=public --remove-port=8787/tcp --permanent
Rstudio Server系统设置
主要修改一下配置文件
/etc/rstudio/rserver.conf
/etc/rstudio/rsession.conf
设置端口和ip控制:
vi /etc/rstudio/rserver.conf
www-port=8787#监听端口,默认是8787，可以修改为其他的
www-address=127.0.0.0#允许访问的IP地址，默认0.0.0.0
rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安装，更改R所在目录
##设置完成记得重启服务器，生效
rstudio-server restart
##会话配置管理
vi /etc/rstudio/rsession.conf
session-timeout-minutes=30#会话超时时间
r-cran-repos=http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN #CRAN资源库
Rstudio Server其他命令
ifconfig ##查看服务器ip地址。
查看运行中R进程
rstudio-server active-sessions
指定PID，停止运行中的R进程
rstudio-server suspend-session <pid>
停止所有运行中的R进程
rstudio-server suspend-all
强制停止运行中的R进程，优先级最高，立刻执行
rstudio-server force-suspend-session <pid>
rstudio-server force-suspend-all
RStudio Server临时下线，不允许web访问，并给用户友好提示
rstudio-server offline
RStudio Server临时上线
rstudio-server online
7.通过浏览器连接Rstudio-server
直接打开浏览器，输入http://<服务器ip>:8787 ## 如果修改过rserver.conf文件，后面的8787端口改为相应的端口即可。
这里需要我们输入用户名和密码。
关于用户名有2点注意事项：
（1）.不允许使用system 用户登陆，即用户ids小于100的用户。只能用普通用户登录
（2）.用户的认证可以使用RSA。
如果没有普通用户，可以添加：
useradd newname # 添加一个名为newname的用户
passwd newname ###给新用户newname 设置密码，密码需是复杂密码，否则可能通不过。
usermod -G happy newname ####将新用户newname添加到happy 用户组中，
在用useradd添加用户之后，在默认的情况下，该账号是暂时被封锁的， 也就是说，该账号是无法登录，须要用passwd命令来给新创建的用户设置密码之后才可以使用。
可能存在的问题
如果你的rstudio-server没有启动 很大程度是安装有误，这里我将我遇到的错误分享出来
rstudio-server verify-installation
报错
There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that
it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did not
configure with --enable-R-shlib.
这里就提到无法找到libR.so文件，原因是配置R语言文件时，没有加参数--enable-R-shlib.
这就必须要重新安装R语言。使用make uninstall 删除之前的安装，最好也删除R-3.6.1所在的文件夹，用“rm -r R-3.6.1".
普通用户无法启动rstudio-server
sudo rstudio-server start## 以管理员方式执行命令
#这时会需要输入密码并提示
xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported.
如果不想出现上面的提示，就是给该用户提高权限，添加用户使用sudo的权利。
su root ###切换到root用户，如果有root权限的话。
chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的写权限
vi /etc/sudoers ###编辑sudoers文件，添加权限。
找到这行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (这里的xxx是你的用户名)
###ps:这里说下你可以sudoers添加下面四行中任意一条
youuser ALL=(ALL) ALL
%youuser ALL=(ALL) ALL
youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
%youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
##第一行:允许用户youuser执行sudo命令(需要输入密码).
##第二行:允许用户组youuser里面的用户执行sudo命令(需要输入密码).
##第三行:允许用户youuser执行sudo命令,并且在执行的时候不输入密码.
##第四行:允许用户组youuser里面的用户执行sudo命令,并且在执行的时候不输入密码.
chmod u-w /etc/sudoers ##撤销sudoers文件写权限
限制普通用户可以使用sudo命令了
R中的一些有帮助解决安装问题的命令
R.home() ## 查看R的安装目录
R.Version()[13] ## 查看R版本
Sys.getenv("R_HOME")
.Library ##查看lib位置
.libPaths() ##查看lib位置
