今天1天都在安装R package,并测试。现在总结一下。吸取一些教训。
第一,首先是安装一个有关免疫的包:immunedeconv。说实话,很难安装,从最初的用Linux系统,用ubantu下载,好不容易下载完成了,不会载入。
今天,从新用rstudio来试试。
安装过程中老是报错,不知道问题出现在哪里?
后来,我干脆把这个报错放在Google里搜索,还是那句话,你遇到的错误,别人可能早遇到过来,搜索看。
果然,看到简书里有篇也是同样的问题。https://www.jianshu.com/p/4bbb88204e8f
在R中安装github R包时弹出了下方的错误
解决办法:
在R的窗口上运行Sys.setlocale(category = "LC_ALL", locale = "us")即可解决
输入install_github('dviraran/xCell'),成功安装该包。
我按照他的办法试了一下,果然,可以下载了,由于这个包太大。中间在下载MCPcount的时候又提示下载失败。
这次的错误由于新花样了。
首先压缩文件是下载了。干脆直接手动安装。把。从rstudio界面的tools进入点解install,选择R包文件目录。就成功。