通常用的蛋白质浓度测定方法是Bradford 、BCA 以及在280 nm 处的光吸收。实验室倾向于选择一些特定的方法，在订购新的试剂前先试用实验室的常规方法。Brad ford法是最好的一种可以用来满足所有目的的方法。
不能直接用一种方法的结果与另一种方法进行比较，必须相对浓度来比较，例如，用Bradford 法测量到的牛血清清蛋白的量比其称量的值高两倍。
蛋白质样品的特点决定选择何种测量方法。如果知道纯化的蛋白质中没有色氨酸，就不要依赖280nm的光吸收值。如果蛋白质样品中有去污剂，就必须选择一种对去垢剂不敏感的方法，或者去除去污剂。
用任何一种方法测量未知样品都要依据标准曲线，而且每次测量时都一样。如果要知道相对蛋白质的浓度，任何纯化的蛋白质都必须选择一条参考的曲线。牛血清清蛋自(BSA) 和lgG 是通常用的参照蛋白质，除非要测量抗体，一般都使用BSA 。
BCA
工作原理：将硫酸铜加到BCA (bicinchonic acid) 的碱性溶液中，产生一种苹果绿颜色混合物，当溶液中加入蛋白质样品时， Cu2＋ 与蛋白样品中的肽键相互作用转变成Cu+，混合物的颜色转变成紫色，在562 nm下有最大吸收值。
优点：快速、灵敏、准确。
缺点：受到去污剂和有机溶剂的影响，有时间依赖性，颜色会在24 小时发生变化。
Bradford
工作原理：染料考马斯亮兰G250 在pH<l 时呈红棕色，与蛋白质结合后引起pKa值的变化，颜色就会变蓝，蓝色强度可以在595 nm 测量。
优点：快速、灵敏、准确、没有时间依赖性。
缺点：去污剂的浓度不能超过0.2% ，否则会干扰测量的结果。
280 nm 光吸收值
工作原理：芳香族氨基酸，尤其是色氨酸，在280nm有强烈的光吸收。所有的蛋白质都有芳香族氨基酸（或者紫外吸收因子），在280nm有独特的消光系数。
优点：快速，样品不会受到干扰。
缺点：没有其他方法准确。
双缩脲法(Biuret)
工作原理：测量肽键，在540nm测定OD值。
优点：快速，由于盐浓度的干扰比Bradford 法小，可用于追踪蛋白质分离过程。
缺点：低浓度时测量不准确。
Lowry (Folin-Ciocalteu) 法
工作原理：与BCA 法类似， 在750nm测定OD 值。
优点：需要很少的物质。
缺点：取决于蛋白质样品中酪氨酸的存在。
