三种计算距离的方法

欧几里得距离

欧几里得距离也叫做(欧氏距离)是欧几里得空间中两点的“普遍”(直线距离)。

缺点主要有两个:(1)将各个分量的量纲(scale),也就是“单位”当作相同的看待了。(2)没有考虑各个分量的分布(期望,方差等)可能是不同的。

举个例子:二维样本(身高,体重),其中身高范围是150-190,体重范围是50-60,有三个样本:a(180,50),b(190,50),c(180,60)。那么a与b之间的闵氏距离(无论是曼哈顿距离、欧氏距离或切比雪夫距离)等于a与c之间的闵氏距离,但是身高的10cm不等价于体重的10kg。

代码实现

import numpy as np
np.linalg(vector1-vector2, ord=2)

巴氏距离

在统计中,Bhattacharyya距离测量两个离散或连续概率分布的相似性。它与衡量两个统计样品或种群之间的重叠量的Bhattacharyya系数密切相关。Bhattacharyya距离和Bhattacharyya系数以20世纪30年代曾在印度统计研究所工作的一个统计学家A. Bhattacharya命名。同时,Bhattacharyya系数可以被用来确定两个样本被认为相对接近的,它是用来测量中的类分类的可分离性。

巴氏距离的定义
对于离散概率分布 p和q在同一域 X,它被定义为:


其中

它是Bhattacharyya系数。

马氏距离

由印度科学家马哈拉诺比斯提出,表示数据的协方差距离。是一种有效的计算两个位置样本集相似度的方法。与欧氏距离不同的是他考虑到各种特性之间的联系并且是尺度无关的,即独立于测量尺度。如果协方差矩阵为单位矩阵,马氏距离就简化为欧式距离,如果协方差矩阵为对角阵,其也可称为正规化的马氏距离。

有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S, 而其中向量Xi与Xj之间的马氏距离定义为:

优点:(1)它不受量纲的影响,两点之间的马氏距离与原始数据的测量单位无关。(它考虑到各种特性之间的联系(例如:一条关于身高的信息会带来一条关于体重的信息,因为两者是有关联的)并且是尺度无关的(scale-invariant),即独立于测量尺度);(2)马氏距离还可以排除变量之间的相关性的干扰。

缺点:(1)夸大了变化微小的变量的作用。(2)受协方差矩阵不稳定的影响,马氏距离并不总是能顺利计算出。即计算马氏距离过程中,要求总体样本数大于样本的维数,否则得到的总体样本协方差矩阵逆矩阵不存在。(3)如果样本的维数非常大,那么计算它的协方差矩阵是十分耗时的
代码实现:

import numpy as np
x=np.random.random(10)
y=np.random.random(10)

#马氏距离要求样本数要大于维数,否则无法求协方差矩阵
#此处进行转置,表示10个样本,每个样本2维
X=np.vstack([x,y])
XT=X.T

#根据公式求解
S=np.cov(X)   #两个维度之间协方差矩阵
SI = np.linalg.inv(S) #协方差矩阵的逆矩阵
#马氏距离计算两个样本之间的距离,此处共有10个样本,两两组合,共有45个距离。
n=XT.shape[0]
d1=[]
for i in range(0,n):
    for j in range(i+1,n):
        delta=XT[i]-XT[j]
        d=np.sqrt(np.dot(np.dot(delta,SI),delta.T))
        d1.append(d)

表格统计

欧氏距离 巴氏距离 马氏距离
优点 易于理解、适用于大多数场景 可以测量两个离散或连续概率分布的相似性。 (1)它不受量纲的影响,两点之间的马氏距离与原始数据的测量单位无关。
(2)马氏距离还可以排除变量之间的相关性的干扰。
缺点 (1)将各个分量的量纲(scale),也就是“单位”当作相同的看待了。(2)没有考虑各个分量的分布(期望,方差等)可能是不同的。 使用场景较少 (1)夸大了变化微小的变量的作用。
(2)受协方差矩阵不稳定的影响,马氏距离并不总是能顺利计算出。
(3)如果样本的维数非常大,那么计算它的协方差矩阵是十分耗时的!
相同点 (1)如果马氏距离的协方差矩阵为单位矩阵,马氏距离就简化为欧氏距离 (2)欧氏和马氏都是计算两个未知样本集的相似度的方法。 (3)欧氏和马氏距离都可以计算多维度数据
不同点 (1)马氏距离它不受量纲的影响,两点之间的马氏距离与原始数据的测量单位无关而欧氏当各个分量为不同性质的量时,“距离”的大小与指标的单位有关。它将样品的不同属性之间的差别等同看待 (2)马氏距离的计算是不稳定的而欧氏和巴氏是稳定的 (3)巴氏距离测量两个离散或连续概率分布的相似性
公式

参考博客:
https://blog.csdn.net/jideljd_2010/article/details/39938555
https://blog.csdn.net/shenbo2030/article/details/44226919
https://blog.csdn.net/mousever/article/details/45967643

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 201,784评论 5 474
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 84,745评论 2 378
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 148,702评论 0 335
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,229评论 1 272
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,245评论 5 363
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,376评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,798评论 3 393
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,471评论 0 256
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,655评论 1 295
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,485评论 2 318
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,535评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,235评论 3 318
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,793评论 3 304
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,863评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,096评论 1 258
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,654评论 2 348
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,233评论 2 341

推荐阅读更多精彩内容