零代码 | 超级实用绘制基因家族结构图进化树组合图

很巧在简书看到有人在推一个比较好用的绘制基因结构进化树组合的可视化软件,不需要任何代码,看着出的图片都非常精美,所以下载来推荐给小伙伴。这个软件相当于GSDS的本地版http://gsds.gao-lab.org/index.php也能绘制进化树图,Motif图,结构域图,启动子图, BED文件 等多种图表的绘制和组合绘制,但是使用起来非常方便,出的图片比GSDS漂亮许多,可以直接用于SCI论文中。

image.png

开发了一个绘制基因结构和蛋白质结构的工具(CFVisual)。CFVisual可以将系统发育树、基因结构和蛋白质结构绘制在一张图中,并具有丰富的交互功能,可以满足研究人员的工作需求。此外,它还支持上述分析图像的任意拼接。它已成为基因家族分析的得力助手。CFVisual包是用Python实现的,可以从https://github.com/ChenHuilong1223/CFVisual/免费获得。

电脑版下载地址:https://github.com/ChenHuilong1223/CFVisual/releases/tag/2.1.5

image.png

如何使用

上面介绍了如何下载,那具体软件怎么使用呢?

image.png

直接使用文中自带的示例文件进行演示:

image.png

点击开始即可:

image.png

如果对颜色,图形不满意可以进行编辑,进行Redraw就行

image.png

修改后得到的

image.png

同时为了为了方便写论文时描述外显子-内含子的长度和数量等信息,这是很多小伙伴关心的一个问题,点击Statistics按钮即可。

image.png

具体的使用方法

可以参考下载参考说明,写的非常清楚,作者还是非常用心的,能把一个软件功能写的那么的详细,感谢!
颜色的问题

CFVisual可以 识别 的 交互 格式 文件:从 左 到 右 的 列 分别 表示 为:基因 名 、 形状 符号、 形状 尺寸、 形状 填充 颜色 和 形状 轮廓 颜色。其中, 形状 符号 理解 如图 40 颜色 参数 支持 常用 的 8个 表示 颜色 的 单词 或 简写 图 41 和 十六 进制 的 颜色 编码 字符 串 图 42这里 作者 推荐 菜鸟 工具 中 的 一个 板块 https://c.runoob.com/front-end/55 因 为 不仅 支持 颜色 查找, 也 支持 RGB格式 和 十六 进制 颜色 编码 字符 串 的 相互 转换 值得 收藏

image.png

image.png

图像的问题

树图 分类 控制 文件 的 格式 如下 图从 左 到 右 的 列 分别 表示 为:分类 区域 上端 或下端 的 基因名 、 分类 区域 下端 或 上端 对应 的 基因 名 、 颜色 和 分 类 的 标签 。注意:每一行 对应 一个 分类 区域 第四 列 可以 不提供。

image.png

功能强大实用

用户 充分 利用 CFVisual的 树图 分类 功能, 真的 可以 不用 再 用 Ps或 Ai等 修图 工具 去 修饰 了。然后, 作者 展示 两张 样图 以供参考,希望大家多多学习,软件真的非常nice好用。

image.png

今天就先给大家介绍到这里,希望大家的科研能有所帮助!祝您科研顺利快乐!


生信漫谈

生信漫谈

生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 199,519评论 5 468
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 83,842评论 2 376
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 146,544评论 0 330
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 53,742评论 1 271
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 62,646评论 5 359
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,027评论 1 275
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,513评论 3 390
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,169评论 0 254
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,324评论 1 294
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,268评论 2 317
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,299评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 32,996评论 3 315
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,591评论 3 303
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,667评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 30,911评论 1 255
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,288评论 2 345
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 41,871评论 2 341

推荐阅读更多精彩内容