矗立在格尔登寺院西南侧的格尔登寺大佛塔是雪域高原上屈指可数的几座大型佛塔之一。1987年10月由政府拨款和自筹部分资金修建的格尔登寺大佛塔竣工开光，正式向信教群众开放、朝拜。
格尔登寺大佛塔全高49米，正方形底座边长25米的，佛塔外围是环塔转经走廊，有数百个小经轮和十余个大型转经轮，环全寺有数千个大小转经筒。转经筒内装满了经活佛加持过的经书、圣物，转经轮印有藏文兰扎体的六字大明咒“嗡嘛呢叭咪哞”，意为大慈大悲的观音菩萨护佑加持。四条挂满五彩龙达的钢绳从金碧辉煌的塔顶向四周拉开，彩幡随风飞舞。两旁的大转经房内是两个巨型的转经筒，在转经人的推动下不停转动，把信众的祈愿传向天空。
佛塔前圆锥形石堆为嘛呢堆，石堆上的每一个石头是信众口诵经咒从远处拾来放在上面的，这样每一块嘛呢石都在风中为信徒呤唱祈祷，同时也是信众献给三宝的贡品。佛塔左下侧堆放的是刻有各种经文、佛像的石经板，是信众在石头、大理石、玉石上雕刻的藏文经典和佛像，也是信众对佛的祈祷。
抬头望去眼前出现的是围绕大佛塔的24个小佛塔，形成众星拱月的态势。总有许多游客在这里与直指蓝天的大佛塔，吱吱转动的转经轮和塔前的嘛呢堆、五彩的神秘石经板照相留影。
佛塔第一层：去恶净心慈悲殿。走进佛塔大门，正面是一尊木雕的千手千眼观音佛像，你看她的周围整齐地排列着无数的手掌，每个手掌中都镶嵌着一只明亮的慧眼，而且这尊佛像有许多头。这些头标志着这是万能智慧济世救苦的菩萨，这千手可以帮助我们解救世间一切苦难，手中千只慧眼是智慧聪颖的法眼，帮助我们洞察秋毫，普度万物众生。大佛像前是唐朝时的藏王松赞干布和大唐下嫁和亲的文成公主及尼泊尔公主，这是藏汉人民世代友好的历史见证。前面的“曼扎”是锥形的，有方形的、平面的、木雕的、沙盘的，它代表有无穷的意义，主要表示向三宝供养之意。我们可以看到，在这个大佛像周围壁上有1亿个莲花生佛像，1千个小佛塔，1千个释迦牟尼佛像，右侧有财神南木扎西，游客可在塔前煨桑台向观音、财神供桑烟祈愿。
佛塔第二层是长寿佛殿，主供的是无量寿佛，保佑大家长命百岁平安长寿。四周供有1千尊小无量寿佛和18罗汉佛像。
第三层是宗喀巴佛殿，主佛是宗额巴大师，四周供有1千尊宗喀巴小佛像和他的1000部文集。
第四层是莲花生佛殿，主佛是莲花生大师，四周供有第1—11世格尔登喇嘛佛像和大白伞盖度母佛像。
第五层是四手大白伞度母佛像，是去恶从善的清净慈悲佛。旁边供有宗喀巴及二贤弟子佛像。犯过错的人可以在这里忏悔过去，洗心革面重新做人。
