有些辣椒种子需要浸泡是因为浸泡可以帮助种子保护膜的分解并且加快辣椒的生长。常用的浸种方法有温汤浸种法、热水浸种法和常规浸种法。
温汤浸种法是将种子浸入50℃-55℃的温水中，搅拌待水温下降至30℃时停止搅拌，再浸泡8-12小时，这种方法对辣椒疮痂病、菌核病有杀菌作用。
热水浸种法是先用温度为25-30℃的温水浸种15分钟左右，然后用温度为55-60℃的热水浸种10-15分钟，最后再用温度为25-30℃的温水浸种5-6小时，该法的主要优点是在浸种的初期，利用热水对种子进行消毒处理。
常规浸种法是直接用温度为25-30℃的温水来浸泡辣椒种子，直到把种子泡透为止，在水温适宜时，一般需要浸种5-6小时，该浸种法通过为种子提供温度适宜的水，使种子能够迅速地吸足发芽所需要的水分，但该浸种法只是对种子起供水作用，没有对种子消毒和明显促进种子吸水等功能，主要用于消过毒的辣椒种子浸种。
