小明的数据分析笔记本公众号 主要分享:
1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;
2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;
3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记!
这个是微信公众号合集的推文链接
https://mp.weixin.qq.com/s/8wiO9QpW-1o4qE_C_AIfCg
1、R语言ggplot2作图一些好看的颜色搭配
2、R语言画三维散点图展示主成分分析(PCA)的结果
3、R语言ggplot2数据可视化之图中嵌图
4、R语言ggplot2可视化展示我国第七次人口普查的基本数据~人口总量和地区分布
5、R语言ggplot2分组箱线图(boxplot)添加显著性标记简单小例子
6、R语言ggstar包:给散点图的形状提供更多的选择
7、R语言pheatmap画热图遇到的一个报错及原因
8、R语言ggplot2画棒棒糖图展示中国十大姓氏
9、R语言GOplot画弦图展示GO富集分析的结果之如何准备自己的数据
10、可能会用到的30个R语言包~第四期
11、R语言ggplot2折线图(line plot)添加置信区间(CI)展示学术论文作者数量的变化趋势
12、R语言ggplot2绘制经验累积分布(empirical cumulative distribution)曲线的简单小例子
13、R语言ggplot2画小提琴图(violin plot)展示学术论文作者数量
14、R语言ggplot2漂亮的热图和配色简单小例子
15、R语言的ggplot2做共线性结果可视化的第一篇笔记
16、R语言maftools包画oncoplot(瀑布图)的一个简单小例子
17、Circoletto可视化Blast结果的简单小例子
18、R语言做主坐标分析(PCoA)的一个简单小例子
19、答读者问:R语言ggplot2如何给坐标轴添加表示分组的线段
20、跟着Science Advances学画图:R语言ggplot2画图如何让坐标轴以科学计数法显示
21、跟着Science Advances学画图:R语言ggplot2画柱形图如何让屁股朝右
22、ggplot2作图共享图例方法一:ggpubr包的ggarrange()函数以及调整图例的布局
23、R语言fmsb包画雷达图(radar plot)的一个简单小例子
24、ggplot2画点和分组椭圆展示主成分分析(PCA)结果的简单小例子
25、ggplot2画点和连线展示主成分分析的结果简单小例子
26、R语言ggplot2分组的小提琴图加箱线图简单小例子
27、答读者问:R语言ggplot2绘制热图展示GO富集分析结果的简单小例子
28、R语言ggplot2两个离散变量画热图的简单小例子
跟着论文学作图系列
1、跟着Nature Genetics学画图:R语言ggplot2画曼哈顿图展示XP-CLR score
2、跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2画基因结构示意图
3、跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2一次性画好多个饼状图
4、跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2画箱线图(boxplot)展示D statistic
5、跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2散点图展示PCA结果
6、跟着Nature Genetics学二代测序数据分析:使用NOVOPlasty组装生菜的叶绿体基因组
7、跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2画地图并且叠加饼状图的简单小例子
8、跟着Nature Medicine学画图:R语言画堆积柱形图以及时间格式数据做坐标轴的操作
9、跟着Nature Medicine学画图:R语言散点图组合频率分布图的简单小例子
10、跟着Nature Methods学画图:R语言ggplot2画小提琴图
11、跟着Nature Methods学画图:R语言ggplot2散点图并添加拟合曲线和置信区间
12、跟着Nature Methods学画图:R语言ggplot2+ggtree+aplot画气泡图组合聚类树图
13、跟着Nature Methods学画图:R语言ggplot2画气泡图(dotplot)展示基因表达量
14、跟着Nature Methods学画图:R语言画热图(pheatmap)展示基因表达量
15、跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析:R语言做方差分解的一个简单小例子