医学英语论文的规则和格式，不同杂志往往其特殊的规定。在论文撰写及投稿之前，应仔细阅读这些要求，避免或降低因为文章架构不规范导致的拒稿。在结构上SCI论文大多包括标题、摘要、引言、方法、结果、讨论、结论、致谢和参考文献等部分。
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标题
标题一般采用名词词组或名词短语的形式，个别杂志也允许陈述句的形式。标题必须简单、明了，醒目。
通过标题，读者能明白论文所要描述的研究对象和研究内容，以及论文的主要创新独到之处。标题是否合适往往影响着编辑/审稿人是否进一步阅读摘要乃至全文。
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摘要
摘要是整篇论文的缩影，对其的要求是简练明快，易于阅读， 信息量大，能涵盖论文的重点。摘要有结构性（structured）和非结构性（unstructured）2种形式，但均包括研究目的、方法、结果和结论4个基本要素。
摘要应格外注意语言规范。句子结构宜简单、严谨，准确表达论文原意，尽量使用简单句。高质量的摘要能增加稿件被接受的机会，激发读者阅读兴趣并提高论文的影响力。
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引言
引文，作为论文的开头，主要目的是为了提出问题，说明本研究的必要性。引言的基本框架，首先简单扼要介绍研究相关的历史、现状，目前的研究热点，以及作者对已有成果的评价。
目前研究现状尚有什么缺陷或不足之处，尚有什么困难和问题需要进一步解决。从而引出本研究的目标和目的。这样层层递进，最终要突出本研究的创新性、经济社会效益和应用前景等。笔者认为引言部分一般不必过长，2 — 3 段即可。
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方法
方法部分主要介绍实验步骤和流程，该部分要自成体系。根据作者描述的有关方法、步骤，不必借助参考文献，可以将研究进行重复。
对于首创的技术方法，应将其技术原理及公式推导形成等细节均叙述清楚。即使使用前人使用的标准方法，也要进行简洁完整地叙述。
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结果
结果部分要求直接、客观描述遵照本研究方法获得的结果，包括观察、检测、比较和分析的结果等。结果的描述，图和表格的形式，因简洁、直观，较单纯文字更能清楚说明相关事实，尽量采用。
可配以必要的文字描述，但切忌累赘、重复。一般杂志限制图和表的总数为 6 — 8 个，所以要坚持以最少的图和表，提供最多信息的原则。必要时可利用图片编辑工具将过多的图片予以合并。
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讨论
讨论部分是根据研究结果结合参考文献得出最终研究结论的过程。讨论部分要对关键的研究结果进行简明扼要的解释，并分析出现或未出现预期结果的原因。对文献中同类或相关的研究结果进行比较、分析，指出与本研究的异同，突出本研究的创新性。在充分的事实和文献理论支持基础上，提出本研究结果潜在的学术价值和广泛的应用前景。
新入门的研究生在讨论部分最常见的问题，包括在讨论部分重复引言部分内容，再次赘述研究背景，说明研究的合理性和必要性，大篇幅重复研究结果部分的描述。我们的建议是，讨论是作者对研究的结果的判断，说明或解决了什么问题，有什么临床或实际意义。可以对结果的关键部分进行简明扼要的重复，但不应原样重复照搬。
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结论
结论是对全文的总结，是根据研究的主要发现和成果并经过分析讨论进行的概括和归纳。结论必须立足本研究结果，切忌盲目放大。
行文力求简洁，重点突出。在本部分还就本研究的应用前景、后续研究展望，提出建议。
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致谢
致谢部分主要面向项目的资助者（单位或基金）、探讨过学术思想的同事、审阅过原文的同行，以及其他在课题完成和论文撰写过程中提供帮助，但尚不足以成为作者的个人。
致谢部分展示的是科学研究团队的协作精神和感恩的情怀，应予以重视。但个别杂志不允许将针对个人致谢放在本部分，此时应根据具体情况区别对待。
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参考文献
参考文献的选择是一件非常严肃的事情，直接关系着论文的可信度和作者的声誉。文献应当引用原始研究，而不是文献综述。
应阅读全文，而不是仅仅阅读摘要。也就是做到“精确”引用。另外，不同杂志有不同的文献格式要求，应仔细阅读投稿要求，务求达到标准。
应用Endnote 等参考文献管理软件（点击），可降低参考文献格式方面的错误。
