前言
暂存区（stage, index）是Git最重要的概念之一，理解了这个概念很多Git命令就不再那么神秘了。下面几个验证例子一开始看不懂没关系，工作区、版本库中的暂存区和版本库之间的关系图先理解先。
正文
下面这个图展示了工作区、版本库中的暂存区和版本库之间的关系。
在这个图中，我们可以看到部分Git命令是如何影响工作区和暂存区（stage, index）的。
图中左侧为工作区，右侧为版本库。在版本库中标记为index的区域是暂存区（stage, index），标记为master的是master分支所代表的目录树。
图中我们可以看出此时HEAD实际是指向master分支的一个“游标”。所以图示的命令中出现HEAD的地方可以用master来替换。
图中的objects标识的区域为Git的对象库，实际位于.git/objects目录下，我们会在后面的章节重点介绍。
当对工作区修改（或新增）的文件执行git add命令时，暂存区的目录树被更新，同时工作区修改（或新增）的文件内容被写入到对象库中的一个新的对象中，而该对象的ID被记录在暂存区的文件索引中。
当执行提交操作（git commit）时，暂存区的目录树写到版本库（对象库）中，master分支会做相应的更新。即master指向的目录树就是提交时暂存区的目录树。
当执行git reset HEAD命令时，暂存区的目录树会被重写，被 master 分支指向的目录树所替换，但是工作区不受影响。
当执行git checkout .或者git checkout -- [file]命令时，会用暂存区全部或指定的文件替换工作区的文件。这个操作很危险，会清除工作区中未添加到暂存区的改动。
当执行git checkout HEAD .或者git checkout HEAD [file]命令时，会用HEAD指向的master分支中的全部或者部分文件替换暂存区和以及工作区中的文件。这个命令也是极具危险性的，因为不但会清除工作区中未提交的改动，也会清除暂存区中未提交的改 动。
当执行git rm --cached [file]命令时，会直接从暂存区删除文件，工作区则不做出改变。
当执行git rm file命令时，会同时删除暂存区和工作区的文件。
当执行rm file命令时，只会删除工作区的文件。
下面举例子来证明以上观点
假设：
工作区：a
暂存区（index）:b
HEAD:C
git diff命令结论
git diff 比较a跟b
git diff --cached 比较b跟c
git diff HEAD 比较a跟c
git reset跟 git checkout结论
git reset HEAD c覆盖b
git checkout -- b覆盖a
git checkout HEAD c覆盖a,b
git rm命令结论
git rm 删除a跟b
git rm --cached 只删除b
rm file 只删除a
证明git diff结论
例子，默认新建一个readme.txt，里面输入内容one然后add并且commit一次。
1：修改readme.txt，新增内容two，这时候a内容改变了,多了two，而b跟c内容不变，都只有one。
执行git diff readme.txt查看效果
结论：如图看出，内容有修改， a跟b比较了
执行git diff --cached readme.txt查看效果
结论：如图看出，没有变化，因为b跟c内容一样。
执行git diff HEAD readme.txt查看效果
如图所示：内容有修改，a跟c比较了
2.这时候执行git add readme.txt,这时候a，b内容都多了two，而c内容不变，只有one
执行git diff readme.txt查看效果
结论：如图看出，没有变化， 因为a跟b内容一样。
执行git diff --cached readme.txt查看效果
结论：如图看出，内容有修改，b跟c比较了
执行git diff HEAD readme.txt查看效果
结论：如图看出，内容有修改，a跟c比较了
3.最后使用git commit提交一次，这时候a,b,c内容都一样，都包含two。
结论，如图看出，没有变化，说明a,b,c内容一样
根据上面的实例再一次证明了如下观点：
git diff 比较工作区跟暂存区
git diff --cached 比较暂存区跟HEAD
git diff HEAD 比较工作区跟HEAD
证明git reset跟 git checkout结论
例子，默认新建一个readme.txt，里面输入内容one然后add并且commit一次，这时候a,b,c内容都是one
1.修改readme.txt，新增内容two，执行git add readme.txt操作，这时候a ,b内容都多了two,c还是只有one.
执行git reset HEAD -- readme.txt命令后，c覆盖b,这时候b内容也变成只有one了，使用git diff readme.txt命令可以看到，有内容修改，a跟b内容不一样。
2.此时a内容有two,b和c都只有one，执行git checkout -- readme.txt后，b覆盖a,此时a,b,c都是one。执行git diff readme.txt命令可以看到，没有改变。
3.此时a,b,c都只有one，修改一下，添加内容two，执行git add readme.txt和git commit -m "two".再修改一次readme.txt,添加内容three,然后会执行git add readme.txt，此时a跟b都包含three，而c只包含one跟two。执行git checkout HEAD readme.txt后，c覆盖a和b,a,b里面内容都只有one跟two。分别使用命令git diff --cached和git diff HEAD来查看b跟c，a跟c的比对，发现都一样。
根据上面的实例再一次证明了如下观点：
git reset HEAD HEAD覆盖暂存区
git checkout -- 暂存区覆盖工作区
git checkout HEAD HEAD覆盖暂存区和工作区
证明git rm 结论
默认新建一个readme.txt，里面输入内容one，然后使用git add readme.txt命令。
1.执行git rm readme.txt命令，发现文件被删除了。
2.再新建一个一个readme.txt，里面输入内容 one，然后使用git add readme.txt命令。执行git rm --cached readme.txt命令，发现文件内readme.txt还在，然后执行git status命令，发现是Untracked状态，也就是未add，这就说明暂存区被删除了。
根据上面的实例再一次证明了如下观点：
git rm file 会将文件从缓存区和你的硬盘中（工作区）删除
git rm --cached 只删除暂存区，不删除工作区
rm file 只删除工作区
