aplot
Y叔开发,拼图解决坐标对齐的问题
extrafont
解决ggplot2绘图导出pdf文件中文字体乱码的问题 对应的B站介绍视频https://www.bilibili.com/video/BV1ke411p7B4?from=search&seid=18105130207805018028
rstatix
里面有一个函数
sample_n_by()
分组取样,基本用法sample_n_by(iris,Species,size=3)
,还有一些其他用来做数理统计的函数,比如t检验,卡方检验之类的,鉴定离群值的函数identify_outliers()
帮助文档提供的一个例子
demo.data <- data.frame(
sample = 1:20,
score = c(rnorm(19, mean = 5, sd = 2), 50),
gender = rep(c("Male", "Female"), each = 10)
)
identify_outliers(demo.data,score)
还有函数
is_outlier()
直接输入向量鉴定异常值
plantlist
查询和处理植物学名的用R程序包,科学网介绍文章 http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-846673.html
自己可能会用到输入拉丁名然后获取科属信息这个功能
自己看论文的时候遇到拉丁名总会想知道中文名,不知道有没有软件可以实现翻译拉丁文为中文名
pdftools
今天在 生信技能树 公众号 看到的推文 R语言奇淫巧技之pdftools包,操作pdf文件非常方便,用到的时候可以回过头看这篇推文。
bioseq
公众号文章 MEE:生物序列数据处理工具R包bioseq,主要功能是实现了DNA、RNA和氨基酸三种生物序列数据处理。
ggthreed
能够绘制3d效果的饼图
github链接 https://github.com/coolbutuseless/ggthreed
ggforce
绘制部分分离的饼图 https://www.data-imaginist.com/2016/announcing-ggforce/
broom
Convert Statistical Objects into Tidy Tibbles
可以将统计分析的结果转化为数据框,然后写入到文件里
Superheat
复杂数据画热图
ggvenn
韦恩图 github链接 https://github.com/yanlinlin82/ggvenn
Cairo
导出pdf文件字体的问题
代码
install.packages("Cairo")
library(Cairo)
library(ggplot2)
df<-iris
colnames(df)<-LETTERS[1:5]
library(extrafont)
fonts()
p1<-ggplot(df,aes(x=A,y=B))+
geom_point(size=8,color="skyblue")+
theme_bw()+
annotate("label",x=7,y=2.2,label="Iris\nFontFamily")
ggsave(p1,filename = 'test.pdf',
device = cairo_pdf,
family='Times New Roman')
BRRR
在 卖萌哥 的简书推送https://www.jianshu.com/p/f83fee3e5a60发现的这个R包。可以发出声音应用场景是如果R语言程序运行时间比较长,可以在结尾处加上一条命令,程序结束后可以用声音来提醒自己。哈哈哈哈哈,自己试了一下,里面的声音还挺好玩的。
安装方式
devtools::install_github("brooke-watson/BRRR")
现在好像内置52种声音,我自己都试了一遍。最开始想直接写循环,R直接自己退出了。接下来想到能不能在循环的时候设置时间间隔?暂时还不知道如何实现。遂单条命令一个一个运行。
help(package="BRRR")
library(BRRR)
skrrrahh_list()
skrrrahh(sound = 1)
skrrrahh(sound = 2) #
skrrrahh(sound = 3)
patternplot
https://cran.r-project.org/web/packages/patternplot/vignettes/patternplot-intro.html
用额外的图片填充图片的背景
比如以上链接的图片
ggpattern
一些图片
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