可能会用到的R语言包~2

aplot

Y叔开发,拼图解决坐标对齐的问题

extrafont

解决ggplot2绘图导出pdf文件中文字体乱码的问题 对应的B站介绍视频https://www.bilibili.com/video/BV1ke411p7B4?from=search&seid=18105130207805018028

rstatix

里面有一个函数sample_n_by()分组取样,基本用法sample_n_by(iris,Species,size=3),还有一些其他用来做数理统计的函数,比如t检验,卡方检验之类的,鉴定离群值的函数identify_outliers()帮助文档提供的一个例子

demo.data <- data.frame(
  sample = 1:20,
  score = c(rnorm(19, mean = 5, sd = 2), 50),
  gender = rep(c("Male", "Female"), each = 10)
)
identify_outliers(demo.data,score)

还有函数is_outlier()直接输入向量鉴定异常值

plantlist

查询和处理植物学名的用R程序包,科学网介绍文章 http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-846673.html
自己可能会用到输入拉丁名然后获取科属信息这个功能
自己看论文的时候遇到拉丁名总会想知道中文名,不知道有没有软件可以实现翻译拉丁文为中文名

pdftools

今天在 生信技能树 公众号 看到的推文 R语言奇淫巧技之pdftools包,操作pdf文件非常方便,用到的时候可以回过头看这篇推文。

bioseq

公众号文章 MEE:生物序列数据处理工具R包bioseq,主要功能是实现了DNA、RNA和氨基酸三种生物序列数据处理。

ggthreed

能够绘制3d效果的饼图
github链接 https://github.com/coolbutuseless/ggthreed

image.png

ggforce

绘制部分分离的饼图 https://www.data-imaginist.com/2016/announcing-ggforce/

image.png

broom

Convert Statistical Objects into Tidy Tibbles
可以将统计分析的结果转化为数据框,然后写入到文件里

Superheat

复杂数据画热图

ggvenn

韦恩图 github链接 https://github.com/yanlinlin82/ggvenn

Cairo

导出pdf文件字体的问题

代码

install.packages("Cairo")
library(Cairo)
library(ggplot2)
df<-iris
colnames(df)<-LETTERS[1:5]
library(extrafont)
fonts()
p1<-ggplot(df,aes(x=A,y=B))+
  geom_point(size=8,color="skyblue")+
  theme_bw()+
  annotate("label",x=7,y=2.2,label="Iris\nFontFamily")
ggsave(p1,filename = 'test.pdf',
       device = cairo_pdf,
       family='Times New Roman')
image.png

BRRR

卖萌哥 的简书推送https://www.jianshu.com/p/f83fee3e5a60发现的这个R包。可以发出声音应用场景是如果R语言程序运行时间比较长,可以在结尾处加上一条命令,程序结束后可以用声音来提醒自己。哈哈哈哈哈,自己试了一下,里面的声音还挺好玩的。

安装方式

devtools::install_github("brooke-watson/BRRR")

现在好像内置52种声音,我自己都试了一遍。最开始想直接写循环,R直接自己退出了。接下来想到能不能在循环的时候设置时间间隔?暂时还不知道如何实现。遂单条命令一个一个运行。

help(package="BRRR")
library(BRRR)
skrrrahh_list()
skrrrahh(sound = 1)
skrrrahh(sound = 2) #
skrrrahh(sound = 3)

patternplot

https://cran.r-project.org/web/packages/patternplot/vignettes/patternplot-intro.html
用额外的图片填充图片的背景

比如以上链接的图片


image.png

image.png

ggpattern

github主页 https://github.com/coolbutuseless/ggpattern

一些图片


image.png

欢迎大家关注我的公众号

小明的数据分析笔记本

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 203,179评论 5 476
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 85,229评论 2 380
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 150,032评论 0 336
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,533评论 1 273
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,531评论 5 365
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,539评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,916评论 3 395
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,574评论 0 256
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,813评论 1 296
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,568评论 2 320
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,654评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,354评论 4 318
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,937评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,918评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,152评论 1 259
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,852评论 2 349
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,378评论 2 342