学习内容
1 Linux简介
Linux是一个基于 POSIX 和 UNIX 的多用户、多任务、支持多线程和多 CPU 的操作系统,与Windows和Mac一样。
2 Linux与生信
Linux通过强大的命令执行功能,可以实现快速、批量、灵活的处理数据的提取、统计和整理等耗时耗力的重复性工作。
3 Linux登录(Mac)
Mac自带的ubuntu即可直接登录使用,无需下载安装PuTTy。
4 Linux基本操作
4.1 pwd(print working directory)显示当前路径
4.2 mkdir: make directory,创建空目录
mkdir biosoft 存放生信软件
mkdir project 存放项目
mkdir src 存放杂乱
mkdir tmp 存放源代码
4.3 ls 显示所有列表,包括目录和文件
4.4 rm删除目录或者文件
rm: 文件
rmdir:空目录
rm-r: 非空目录
4.5 cd 返回根目录
4.6 vi 新建脚本或者文本文档(vi是linux中的文本编辑器)
输入vi后回车出现的"VIM", 一些vi基本命令如下:
i (insert) 输入
Esc 退出编辑模式,输入以下命令:
:wq 保存后退出vi,若为 :wq! 则为强制储存后退出(常用)
:w 保存但不退出(常用)
:w! 若文件属性为『只读』时,强制写入该档案
:q 离开 vi (常用)
:q! 曾修改过档案,又不想储存,使用 ! 为强制离开不储存档案。
:e! 将档案还原到最原始的状态!
4.7 cat:查看并直接将内容输出到屏幕
head #输出前10行
tail #输出后10行
后面加上-n自定义输出几行,
例如:head -n 3 hello_world.txt 【注意-n与head之间有空格,-n和3之间空格可有可无】
4.8 cp 复制文件
使用cp file1 file2
4.9 mv 将文件移入文件夹或重命名
使用 mv file 路径