惩罚犯罪与保障人权。二者是对立统一的关系。一般二者并重。二者矛盾时，根据利益权衡原则作出选择，以更好地权衡惩罚犯罪，保障人权的直接目的。惩罚犯罪，即惩罚犯罪嫌疑人、被告人；保障人权，是保护犯罪嫌疑人、被告人等诉讼参与人，保护犯罪嫌疑人、被告人的人权是核心。
程序公正与实体公正。二者是对立统一的关系。一般二者并重。发生矛盾时，根据利益权衡原则作出选择。程序公正是指过程的公正。具体内容包括程序参与、程序遵守、程序救济、程序公开（审判公开）、程序中立（审判中立）、程序平等（控辩双方）、程序安定（不重复审判）、程序保障（保障实体、程序权利）。实体公正指结果公正。
公正与效率。公正优先兼顾效率。效率是诉讼期限、轻罪不起诉、简易程序、速裁程序等体现了诉讼效率的理念。
