Malik A, Kim YR, Jang IH, et al (2020) Genome-based analysis for the bioactive potential of Streptomyces yeochonensis CN732, an acidophilic filamentous soil actinobacterium. BMC Genomics 21:1–16. https://doi.org/10.1186/s12864-020-6468-5
链霉菌属的嗜酸性成员是生物聚合物的新次级代谢产物和降解酶的良好来源。在这项研究中，采用了一种基于基因组的方法，对具有代表性的耐中性嗜酸性链霉菌Streptomyces yeochonensis CN732进行了研究，以检测其生物合成和酶活性，以及在酸性环境中适应的任何遗传工具的存在。结果：获得了一个高质量的野牛链球菌CN732基因组草图（7.8MB），G+C含量为73.53%，蛋白质编码基因为6549个。计算机分析预测了多个生物合成基因簇（BGC）的存在，这些基因簇与抗菌、抗癌或抗寄生虫化合物的基因簇相似。然而，在大多数情况下，与已知BGC的相似性水平较低，表明这些预测基因簇的代谢物具有新颖性。高效液相色谱-质谱联用分析也证实了各种新代谢物的产生。通过与相关链霉菌的比较基因组分析，可以鉴定出CN732菌株的特异性基因，以及耐中性粒细胞性嗜酸菌的特异性基因，这表明嗜酸菌在不同环境中的代谢基因丰富。此外，碳水化合物活性酶（CAZyme）的菌株特异性基因以及许多其他单体的存在表明了菌株CN732遗传组成的独特性。此外，还观察到BGC中存在半胱氨酸转肽酶（sortases）。
acid.o.philic 嗜酸的；耐酸的；phil-，philo-=love
