跑模拟总要遇到续跑的问题,因为经常会由于网络或服务器的原因导致模拟中断。gromacs中续跑的指令是 mdrun -s *.tpr -cpi
。
有时也会因为初始设定的模拟时间不够长,想延长模拟时间。这时候用到的指令是tpbconv
,以改变.tpr里设定的模拟时间。再用mdrun -s *.tpr -cpi
续跑。
这里提供一个新的思路。先在初始的.mdp文件里更改模拟时间nsteps
,用grompp
重新生成.tpr文件,再用新生成的.tpr文件mdrun -s *.tpr -cpi
续跑。亲测有效。