使用R进行VENN_维恩图或韦恩图_的绘制_2020-11-08

## 1.导入R包

  library("VennDiagram")

  library("rio")

## 2.设置当前工作目录

  if (length(path) != 0) {

    setwd(path)

  } else {

    setwd("./")

  }

## 3.读取提前准备好的数据

  venn_data_index <- list.files(path = "./", pattern = "^venn_data")

  venn_data <- import(venn_data_index)

## 4.韦恩图数据集大小判断及绘图

  if (length(colnames(venn_data)) == 2){

    venn_list <- list(venn_data[,1], venn_data[,2])

    names(venn_list) <- colnames(venn_data)

    venn.diagram(venn_list, filename = paste0("venn_two_sets_plot.",imagetype), imagetype = imagetype, margin = 0.1, fill = c('red', 'blue'), alpha = 0.50, col = 'black', cex = 1, fontfamily = 'serif', cat.col = c('black', 'black'), cat.cex = 1, cat.fontfamily = 'serif', cat.default.pos = "outer")

    print("====================================================================")

    print("两组的数据的venn图绘制完成!")

    print("====================================================================")

  } else if (length(colnames(venn_data)) == 3){

    venn_list <- list(venn_data[,1], venn_data[,2], venn_data[,3])

    names(venn_list) <- colnames(venn_data)

    venn.diagram(venn_list, filename = paste0("venn_three_sets_plot.",imagetype), imagetype = imagetype, margin = 0.1, fill = c('red', 'blue', 'green'), alpha = 0.50, col = 'black', cex = 1, fontfamily = 'serif', label.col = c("darkred", "white", "darkblue", "white", "white", "white", "darkgreen"), col = "transparent", cat.cex = 1, cat.fontfamily = 'serif', cat.default.pos = "text", cat.pos = 0)

    print("====================================================================")

    print("三组的数据的venn图绘制完成!")

    print("====================================================================")

  } else if (length(colnames(venn_data)) == 4){

    venn_list <- list(venn_data[,1], venn_data[,2], venn_data[,3], venn_data[,4])

    names(venn_list) <- colnames(venn_data)

    venn.diagram(venn_list, filename = paste0("Venn_four_sets_plot.",imagetype), imagetype = imagetype, col = "black", lty = "dotted", lwd = 3, fill = c("cornflowerblue", "green", "yellow", "darkorchid1"), alpha = 0.50, label.col = c("orange", "white", "darkorchid4", "white", "white", "white", "white", "white", "darkblue", "white", "white", "white", "white", "darkgreen", "white"), cex = 2.0, fontfamily = "serif", fontface = "bold", cat.col = c("darkblue", "darkgreen", "orange", "darkorchid4"), cat.cex = 1.8, cat.fontface = "bold", cat.fontfamily = "serif")

    print("====================================================================")

    print("四组的数据的venn图绘制完成!")

    print("====================================================================")

  } else if (length(colnames(venn_data)) == 5){

    venn_list <- list(venn_data[,1], venn_data[,2], venn_data[,3], venn_data[,4], venn_data[,5])

    names(venn_list) <- colnames(venn_data)

    venn.diagram(venn_list, filename = paste0("venn_five_sets_plot.",imagetype), imagetype = imagetype, lty = "dotted", lwd = 2, col = "black", fill = c("dodgerblue", "goldenrod1", "darkorange1", "seagreen3", "orchid3"), alpha = 0.60, cat.col = c("dodgerblue", "goldenrod1", "darkorange1", "seagreen3", "orchid3"), cat.cex = 0.8, cat.fontface = "bold", margin = 0.07, cex = 0.8)

    print("====================================================================")

    print("五组的数据的venn图绘制完成!")

    print("====================================================================")

  }

  ## 5.打印绘制韦恩图所需要的R包版本信息和环境变量

  sessionInfo()

  ## 6.结果展示


## 7.说明

颜色和数据都是可以自己根据需要进行调整的,然后就是可以绘制的数据集的限制,此维恩图包只支持绘制5个数据集,如果超出五个就需要用其他工具进行可视化分析了,下期介绍如何使用R绘制花瓣图!此博文如对您有所帮助,请点赞加关注,有问题欢迎讨论!

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 194,457评论 5 459
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 81,837评论 2 371
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 141,696评论 0 319
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 52,183评论 1 263
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 61,057评论 4 355
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 46,105评论 1 272
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 36,520评论 3 381
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 35,211评论 0 253
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 39,482评论 1 290
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 34,574评论 2 309
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 36,353评论 1 326
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 32,213评论 3 312
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 37,576评论 3 298
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 28,897评论 0 17
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 30,174评论 1 250
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 41,489评论 2 341
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 40,683评论 2 335