更新了hisat2的版本后,运行出现了2个错误,
error1:/lib64/libstdc++.so.6: version GLIBCXX_3.4.20 not found
error2: /lib64/libstdc++.so.6: version CXXABI_1.3.8 not found
查阅了网上的解决方法,都说要更新libstdc++.so.6,按照教程操作,一直没有成功,最后参考了好几篇文章,综合了大家的方法,成功更新了,特用此贴,记录过程。
1. 查看系统版本
strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX
GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.1
GLIBCXX_3.4.2
GLIBCXX_3.4.3
GLIBCXX_3.4.4
GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.6
GLIBCXX_3.4.7
GLIBCXX_3.4.8
GLIBCXX_3.4.9
GLIBCXX_3.4.10
GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.12
GLIBCXX_3.4.13
GLIBCXX_3.4.14
GLIBCXX_3.4.15
GLIBCXX_3.4.16
GLIBCXX_3.4.17
GLIBCXX_3.4.18
GLIBCXX_3.4.19
GLIBCXX_DEBUG_MESSAGE_LENGTH
发现少了GLIBCXX_3.4.20,解决方法是升级libstdc++.
2.
sudo yum provides libstdc++.so.6
Loaded plugins: fastestmirror, langpacks
Determining fastest mirrors
libstdc++-4.8.5-39.el7.i686 : GNU Standard C++ Library
Repo : base
Matched from:
Provides : libstdc++.so.6
3.
cd /usr/local/lib64
# 下载最新版本的libstdc.so_.6.0.26
sudo wget http://www.vuln.cn/wp-content/uploads/2019/08/libstdc.so_.6.0.26.zip
unzip libstdc.so_.6.0.26.zip
# 将下载的最新版本拷贝到 /usr/lib64
cp libstdc++.so.6.0.26 /usr/lib64
cd /usr/lib64
# 查看 /usr/lib64下libstdc++.so.6链接的版本
ls -l | grep libstdc++
libstdc++.so.6 ->libstdc++.so.6.0.19
# 删除/usr/lib64原来的软连接libstdc++.so.6,删除之前先备份一份
sudo rm libstdc++.so.6
# 链接新的版本
sudo ln -s libstdc++.so.6.0.26 libstdc++.so.6
# 查看新版本,成功
strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX
...
GLIBCXX_3.4.18
GLIBCXX_3.4.19
GLIBCXX_3.4.20
GLIBCXX_3.4.21
GLIBCXX_3.4.22
GLIBCXX_3.4.23
GLIBCXX_3.4.24
GLIBCXX_3.4.25
GLIBCXX_3.4.26
GLIBCXX_DEBUG_MESSAGE_LENGTH
...