大家都知道高通量测序，那你知道测序的接头是如何加上去的吗？
如上图所示大致步骤如下：
用酶或者激光或者超声波将Genomic DNA或者由RNA反转组得到的双链cDNA打断成小片段；
打断是随机打断，有可能末端不平整，还需要用酶补平；
补平之后，需要在3’端加A碱基；
加上A之后，再加adapter。
涉及的基本概念
1、adapter
接头，为一段已知的短核苷酸序列，用于链接未知的目标测序片段
2、index或barcode
几个碱基组成的寡核苷酸链，用于在混合测序时，区分不同样本
3、insert
待测序的目标序列，位于两个adapter之间
测序片段包括几个部分：universal_adapter-insert-indexed_adapter
测序由5'端开始，最开始的几个碱基无法测得，第一个adapter在数据输出时去除，由于测序读长的限制，第二个adapter通常测不到。
但是如果插入片段本身较短，测序会测穿，即会得到 insert-部分adapter 这样的read，这里的adapter便是我们常常提到的需要去除的接头部分。
序列信息
1、接头序列（示例）
universal adapter:
5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3’
indexed adapter:
5’-GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC(barcode)ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’
仔细看上面这对接头序列，universal adapter的3'末端的T与待测片段新增的A配对，那么剩余序列的反向互补链为
GATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTAGATCTCGGTGGTCGCCGTATCATT
与 indexed adapter 的前面12个碱基一致
GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC，即两段接头序列部分互补，形成Y型的结构。
2、index序列
可根据fastq序列中的信息获取
@HWI-ST1276:71:C1162ACXX:1:1101:1208:2458 1:N:0:CGATGT
fastq的格式信息不再赘述，第一行最末的 CGATGT 即本次测序所使用的index。
