基因家族和关联分析 - 专题

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Fine mapping定位QTL
作物遗传育种需要发掘对农艺性状有重要贡献的QTL。某一重要农艺性状往往是由多个QTL调控。对这些QTL进行精细定位找出对应的基因对作物的改...

2.2 陈牛牛 0 28
R语言手动计算Tajima's D 和 Fst
原理和公式参考： https://www.jianshu.com/p/c7ba1aa543fe[https://www.jianshu.com/...

0.9 杨康chin 0 9

2021.11.19 | 群体遗传结构、PCA、进化树
常见的群体结构的分析方法有admixture分析、系统发生数分析以及主成分分析等。 1、admixture分析 1）R语言绘图 admixtur...

1.2 千万别加香菜 3 16
全基因组选择的工具（转载）
本文转载自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14395909.html]。个人感...

0.8 Hello育种 0 15
6. GWAS：主成分分析——GCTA
利用协方差矩阵，特征值和特征向量将高纬变量投影到数个低维变量的过程； PCA分析的过程就是从千万级别的SNP位点中提取关键信息，以便使用更少的变...

1.2 Wei_Sun 11 29
杂合度
1 使用plink挑选个体注意bsz.txt是要提取的样本名，为两列。

0.1 铃_0d92 0 1
PLINK+TASSEL做GWAS+Post-GWAS分析
此视频来自B站，是非常好和全的的一个GWAS操作的视频，从开始准备软件下载，数据过滤，到最后的候选基因注释。GWAS的实战视频https://w...

1.9 Hello育种 6 34

全基因组选择的模型汇总（转载）
本文转载自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14375487.html]。个人感...

1.7 Hello育种 0 27
几种绘制基因组共线图的方法
1.MCscanMCscan绘制共线图MCscan需要准备cds.fasta和.gff注释文件cds.fasta文件可以从基因组序列中提取配置...

0.4 追梦生信人 0 7
缺失基因型填充
作者：陈美佳一、问题描述基因型数据的缺失分为遗传性缺失和检测性缺失： 1、遗传性缺失：个体遗传信息的变异（例如，这个位点DNA片段真实缺失）...

0.6 虾里巴人 0 13