featureCounts是一个用来统计count数的软件，运行的速度飞快，比之前用的htseq-count快了好多好多。 照例先说一下怎么下载...
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Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作图！ -
一句代码同时运行多组富集分析传统的富集分析的步骤是： 计算出差异表达基因列表 运行GO 运行KEGG当然，也可以运行其他富集分析，比如DO，Wikipathways或者Re...
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WGCNA分析 | 你的数据结果真的是准确的吗？？加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关...
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全转录组关联分析（TWAS）全基因组关联研究（GWAS）已经确定了数千种与许多复杂特征相关的遗传变异。然而，它们的生物学机制在很大程度上仍然是未知的。最近提出的全转录组关联...
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RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同
RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同 现在常用的基因定量方法包括：RPM, RPKM, FPKM, ...
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转录组--STAR比对（可用于差异分析、可变剪接分析和call_SNP）
1 建索引 2 比对(若用于GATK，可不排序输出sam文件) 1)常规比对（一次2个吧, 用于差异分析） 2-pass模式（用于RNA数据的G...
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iTAK：在线预测全基因组转录因子TF，转录调节因子TR与蛋白激酶PK前言 康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因子 (TF)、转录调节因子 (...
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WGCNA基础概念WGCNA基础概念 加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation networkanalysis)是用来描述...
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WGCNA得到模块之后如何筛选模块里面的hub基因
WGCNA得到模块之后如何筛选模块里面的hub基因 原创 生信技能树 我在生信技能树多次写教程分享WGCNA的实战细节，见： 一文看懂WGCNA...
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转录组分析（三）--GO及KEGG富集分析及可视化（包括条形图及气泡图）（对差异基因的可视化）
GO分析（上下调基因分开做，可用于BP,CC,MF分开画图） GO分析（上下调一起做，强烈推荐，可以看整体结果，并可选取其中的部分画图） GO ...
专题公告
我们一起学习转录组数据分析
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