无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expr...
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无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biol... -
GFOLD摸索
用到GFOLD是因为我拿到了没有重复的样本，所以试试，第一次做，欢迎大家和我讨论参考文献是：GFOLD大部分安装参考这篇博客我也用到了CORNA...
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nature级别图表：一个注释气泡热图函数（适用于单细胞及普通数据）之前我们写过一个函数，主要是展示单细胞比例图（nature级别图表：单细胞转录组细胞比例统计可视化函数[http://mp.weixin.qq....
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R包 clusterProfiler 比较不同dataset富集结果生物信息分析中，接触最多的莫过于基因富集分析，故在此基础上目前已经开发了很多种富集分析工具，如网页版的DAVID、KOBAS、GOEAST，We...
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无参转录组序列组装 — Trinity转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类： 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装—定量—差异分析—功能富集分析...
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转录组分析--step2 差异分析以下内容根据生信技能树Jimmy老师代码按个人习惯修改而成，欢迎讨论共同进步三种最常用的方法都试一下看看，用function定义函数的写法比较整...
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三种差异分析的整理针对测序数据和芯片数据，目前常用差异分析的R包有edgeR、limma、DESeq2，做一简单比较，方便平时分析。内容多为搬运，主要方便下次寻找...
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【转录组学】如何进行一步到位的fastq到差异分析，kallisto拯救你(一)传统转录组的分析想必大家已经非常熟悉，无非是质控 -> 比对 -> 组装 ->定量 -> 差异分析 -> 差异表达基因功能富集分析这个套路。目前...
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转录组分析5——差异表达分析差异表达分析内容：• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts，RPKM，FPKM，TPM➢ PCA图、热图等• 差异表达分析及可视化➢ ...
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没有生物学重复的转录组数据怎么进行差异分析？设置生物学重复这个环节也是你实验设计很重要的一part，设置的好对你下游分析也有利，通常我们做转录组测序，需要的样本量每组至少为3个生物学重复，...
专题公告
生信小白转录组
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