基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，...
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全 -
学会正确选择多序列比对（coding-sequences）软件前几天，实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析，没想到却在多序列...
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系统发育基础知识介绍
系统发育学概念 系统发生（或种系发生、系统发育，phylogeny）是指生物形成或进化的历史。系统发生学(phylogenetics)研究物种之...
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如何构建SNPs-based phylogenetic tree
如果根据SNP或者Indel 构建其系统进化树，可以展示群体中不同个体的相互关系，基因变异相似的往往会在同一个树的cluster中，一颗好的树可...
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Texshade对多重序列比对进行可视化很早之前就觉得用DNAMAN做的多重比对导出来的图不是很好看了，而且后期还要进行PS或者PPT进行修饰。 因此，到网上去找了一些方法也做了一些尝...
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基于哈希索引的短序列匹配算法(Short Read Mapping by Hash Index Method)前言 : 随着NGS(Next Generation Sequencing)技术日益成熟，如今一台设备一天可产生100G的碱基匹配数据。其产生的...
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后缀树的相关与python实现BWA Burrows-Wheeler Aligner作为一个十分出名的alignment软件，在各个生信领域的比对中都发挥了重要的作用。但是如...
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同源注释工具GeneWise安装和使用
这是一个非常老的软件，距离他不更新至少有10多年了，但是目前还是有很多公司用他进行基因组注释，包括ENSEMBL的注释流程的几个核心部分用到的也...
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序列比对其他相关问题全局比对 Global Alignment 由芝加哥的Needleman和Wunsch两位于上个世纪70年代初提出，常被称之为Needleman...
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CD-HIT学习
CD-hit 参数解读 -i 设置输入文件 -o 设置输出文件，可以将每次分析的ID阈值放到名称中，方便以后使用，如clean90，就是被清洗后...
专题公告
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