Post Bisulfite Adapter Tagging (PBAT)，是Bisulfite建库过程中先转化后加接头的一种建库方式。 提要：...
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PBAT文库 -
使用IGV简单绘制甲基化分布图废话不多说，直接简单粗暴的开始吧 导入基因组 导入基因组文件：Genomes→load geome from file→选择"reference...
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什么时候使用Bismark的non_directional参数Bismark是做甲基化数据分析常用软件，其中有一个--non_directional的参数，默认是不启用，如果需要时未启用该参数，会导致map...
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甲基化套路和甲基化有关的。可以先了解下甲基化：450k甲基化基础450K甲基化芯片数据处理传送门450k甲基化芯片常用工具包：ChAMP和minfi等。 ...
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methylKit甲基化分析
引言 methylKit是一个R软件包，用于分析和注释通过高通量亚硫酸氢盐测序获得的DNA甲基化信息。该软件包旨在处理RRBS及其变体的测序数据...
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识别差异甲基化区域的软件 — DMRfinder
翻译DMRfinder官方说明文档。 Introduction DMRfinder 是一款用于WGBS的C位点提取、鉴定以及DMR分析的软件，具...
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推荐DNA甲基化分析NG上的一篇文献起初是由于自己做DNA甲基化方面然后才突然来了兴趣搜了一下DNA甲基化的文章，结果无意被这一篇NG吸引了眼球。首先进去大体看了一下文章的图（哈哈...
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背景：全基因组分析造血细胞中的DNA甲基化：WGBS的DNA甲基化分析
全基因组分析造血细胞中的DNA甲基化：WGBS的DNA甲基化分析 First Online: 23 July 2017 译者注意：文章感觉什么都...
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滚动聚合（即滚动窗口求和)之RcppRoll 包在看到《R数据科学》第45页时候，突然看到一句话 尽管这里并没有对RcppRoll包进行描述，但是经不住好奇去查了一下这个包 这里我们可以用来计...
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SNP在染色体上的密度分布图有两种方法，先看比较简单的一种： 结果： 第二种方法就比较复杂了，需要准备两个文件：一个是包含染色体长度的文件chr_length.txt...
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