通过前期的分析，我们确定了感兴趣的module，但是module中又含有几十甚至上百的基因，下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA（...
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WGCNA（6）：筛选 hub gene -
mRNA-seq学习（一）：基因差异表达分析和GO注释数据来源：Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylationpredominantly at H...
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转录组差异分析金标准-Limma-voom实战刘小泽写于19.3.11Limma作为差异分析的“金标准”最初是应用在芯片数据分析中，voom的功能是为了RNA-Seq的分析产生的。详细探索一...
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GO和Pathway富集分析的背景基因集
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时，都会涉及到 Background; 做分析时，分析工具会提供一些数据供使用者选择或者使用自定义...
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RNA-seq(4):下载参考基因组及基因注释1.在 UCSC 下载 hg19 参考基因组；2.从 gencode 数据库下载基因注释文件，并且用 IGV 去查看感兴趣的基因的结构，比如TP...
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基因组共线性工具MCScanX使用说明基因组共线性工具MCScanX使用说明 简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整，用于检测共线性和同线性区域，还增加了可视化和下游...
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「基因组学」使用CAFE进行基因家族扩张收缩分析环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder，然后再安装CAFE 数据准备...
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非模式生物基因GO富集分析：以水稻为例
模式生物做什么都简单，非模式生物则很多缺少注释，没有注释你就没法做，只能是借助于各种软件比如blastgo，自己跑电子注释。但今天要讲的不是这种...
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非模式物种GO/KEGG富集分析前言:微博参与话题 #给你四年时间你也学不会生信# 先前的富集分析教程[1]主要是以模式物种人为例子，展开的分析，今天在B站看了孟浩巍视频教程[...
专题公告
生信转录组分析
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