简介   目前，单细胞技术发展迅速，单细胞转录组测序可以帮助我们获得组织中每个细胞的基因表达水平，但却无法获得对应空间位置上的信息。空间转录组技...

第七节：空间转录组分析 在本节教程中，我们将学习空间转录组的一些分析方法。10X Visium平台的空间转录组数据在许多方面是类似于scRNA-...

在数据分析过程中，常常需要把组间的显著性添加到图形中，但是在ggplot2中实现起来略显麻烦，幸运的是，有很多R包可以帮助我们实现这一操作，比如...

之前小编已经分享过很多空间转录组的分析工具（👉 都可以在空间组专辑[https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbu...

hello,上一篇文章中，10X空间转录组数据分析之空间注释（解卷积，STdeconvolve）[https://www.jianshu.com...

hello，大家好，今天我们来分享一个很好的做细胞通讯的分析软件，在原有细胞通讯软件的基础上更上一层，利用单细胞数据从头构建信号网络，今天我们就...

hello，大家好，今天我们来分享一个新的空间注释的方法，当然主要思想还是解卷积，关于空间转录组的注释方法，我已经分享了很多了，在这里列举出来，...

空间转录组学是一个迅速发展的领域，有望以单细胞或亚细胞分辨率全面表征组织结构。计算方法的发展对从原始数据中提取生物信号起着重要作用；下游分析工具...

今天领导非让写微信稿，其实我是不太想写的，但是呢，官大一级压死人，所以写的微信稿原版分享给大家，原版是不会有广告什么的，纯粹就是给大家分享一些好...

我们要实现下面这张图，这是一张10X空间转录组分析得到的图 这张图可以展示基因的区域表达情况，也可以表示10X单细胞和10X空间转录组联合之后，...