在自然群体（区别于强人工选择）中，如果我们感兴趣的数量性状表现出与特定的地理环境变量有高度的关联性，随着环境变量的改变而变化，则这些环境变量往往...
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潜在因素混合模型：LFMM—— R包lfmm -
GWAS全基因组关联分析全流程
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完，从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法，加起来也有二十余篇，按分析的流程整理出一...
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【日常工具】Chrome插件推荐及安装原生的Chrome浏览器相当于新装修的房屋，插件相当于购置的各种电器(ps:吸尘器和洗衣机等等) 方便日常生活；下面介绍几个自己感觉有用的ext...
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转座子（TE,散在重复）特征及其对基因组影响基因组中重复序列大体分为两类：串联重复（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可预测）散在重复（Disp...
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picard:处理HaplotypeCaller断点的问题--gatk提取指定染色体vcf文件
使用GATK4 call snp时总会出错。鉴于GATK4新版的不稳定性，即使有坑也得跳。这里是填坑的地方。 重要信息：所有的vcf一定不要手工...
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RPKM、FPKM、TPM详解
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GO注释结果整理对于非模式生物或者无参考基因组的项目，经常需要进行基因的功能注释，而GO注释是基因功能注释的重要部分。有很多软件能够获得GO注释的信息，例如in...
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转录组入门（3）：质量控制需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的质量！作业，理解测序reads...
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