前言 ChIP-seq 技术是研究蛋白质与DNA相互作用的重要手段，被广泛用于揭示转录因子和组蛋白修饰在全基因组范围内的结合位点的分布情况。...
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MAnorm2：ChIP-seq数据分组比较软件
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TBtools | 全基因组 - 基因密度统计，充实你的图片摘要 两张图总结本文，以方便大家确定是否还有看下去的兴趣 写在前面 Emmm... 今天开放一个旧功能，全基因组基因密度统计。虽然是早前就写好的...
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如何使用ChromHMM鉴定染色质状态趁着零碎的时间整理了下ChromHMM的相关内容。 ChromHMM是基于ChIP-seq组蛋白数据检测染色质状态的工具。 基因组区域特定的组蛋...
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ChromHMM： 染色体状态的分类前言 时间过的真快，一转眼距离上一次发帖已经过去两周的时间，不知道这两周时间自己都忙了些啥，时间就没有了。真的是越穷越忙，越忙越穷啊！ ...
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ChIP-Seq数据挖掘系列-2: Motif 分析(2) - HOMER Motif 分析基本步骤在基因组调控元件分析中，HOMER 可以用于发现新的motif。HOMER 通过比较两个序列集，再使用ZOOPS scoring (zero o...
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ChIP-Seq数据挖掘系列-1: Motif 分析(1) - HOMER 安装
HOMER 是一套用于Motif查找和二代数据分析的工具。HOMER 中的工具是使用Perl 和C++编写的，适用于unix操作系统。基于mot...
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ATAC-seq分析：差异分析（10）在下部分中，我们将研究如何使用 R/Bioconductor 识别开放区域中的变化。 在这里，我们将采用类似于 Diffbind 中的方法，并在...
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第9篇：差异peaks分析——DiffBind学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异p...
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学习一下ChIPpeakAnno(一)刘小泽写于19.10.11跟着Bioconductor的教程学习一下ChIPpeakAnno的基本流程 前言 官网教程在：https://www...
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MACS2学习笔记
安装默认使用Conda macs2的基本命令 输出文件包括 为了方便在IGV上查看ChIP-seq的结果和后期的可视化展示，所以我们需要把mac...
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