最近有小伙伴问道一个问题,如何在一个单细胞UMAP/TSNE图上展示多个marker基因的表达,乍一看挺简单的,后来也是思考了一些时间,慢慢解决...
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更多精彩请至《KS科研分享与服务公众号》除了之前说过的三种常见单细胞基因可视化方法外,还有一种最常用的就是直接在UMAP或者TSNE降维图上显示...
跟着 Cell 学作图 | 5.UMAP降维分析 “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1016/j....
在自然群体(区别于强人工选择)中,如果我们感兴趣的数量性状表现出与特定的地理环境变量有高度的关联性,随着环境变量的改变而变化,则这些环境变量往往...
一、安装 1、conda install -c conda-forge umap-learn 2、进入R:devtools::install_g...
今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中,可以看出,图片分成2个部分,左边是进化树,右边是类似气泡图。 下面我们用一组简单的文件进行...
|本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/04FA3O4QVwg9CNtHBWbUYw[https...
本文包括内容: 1. 基因长度定义 非冗余外显子(EXON)长度之和;挑选基因的最长转录本 ;选取多个转录本长度的平均值;非冗余 CDS 长度之...
论文 The evidence remains clear: SARS-CoV-2 emerged via the wildlife trade...
3010份亚洲稻群体重测序项目是由中国农业科学院作物科学研究所牵头,联合国际水稻研究所、华大基因等16家单位共同完成。该研究对来自89个国家的3...
专题公告
有关R语言的学习与应用