本文章将介绍 ①类blast软件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比较 ②blast、mmseqs、diamond、hmme...
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基因家族鉴定流程（二） 用blast、mmseqs、diamond、hmmer搜索同源蛋白 -
自噬学习三------SQSTM1/p62 知多少？
SQSTM1/p62 知多少？ 原创 瞿飞；经作者同意转自 Autophagy欢迎关注Autophagy公众号，并进加入细胞自噬交流群 导语： ...
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单细胞转录调控网络分析工具（TF，motifs）-SCENIC相信很多专题应该已经讲过SCENIC的使用，这儿，针对我自己对SCENIC的学习使用，遇到的问题做一个详细的讲解说明，希望能对大家理解学习应用S...
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绘制堆叠柱形图（ggplot 2）使用群落微生物物种丰度表数据
群落微生物物种丰度表-绘制堆叠柱形图（ggplot 2） 今天我们先来讲一下如何利用细菌群落的高通量测序数据来绘制堆叠柱形图来展示不同样品中优势...
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ggplot2优雅的绘制火山图关于火山图，绘制的教程有很多也有不少专门绘制火山图的包，说到底火山图无非就是散点图的变形，本节来介绍如何通过ggpotl2绘制火山图 安装&加载...
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unable to find an inherited method for function ‘select’ for signature ‘"data.frame"’报错及处理办法
今天用select函数出现报错，一开始没注意报错信息，因为我选择的列名有些复杂，怕是哪里掉了个空格，就重新换了个方法选列名，还是出错。报错信息如...
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利用MicrobiotaProcess完成LEFse分析（近似）对于Lefse来说，首先测试所有特征在不同类中的值是否存在差异分布。其次，对显著不同的特征进行事后检验，不同类中子类之间的所有两两比较应都明显符...
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微生物多样性qiime2分析流程(6) 数据可视化分析(上）在之前的几篇文章里，介绍了如何整合dada2的分析结果，并且已经通过MicrobiotaProcess包转化为了phyloseq对象，接下来先让...
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Seurat Weekly NO.09 ||UMAP图分不开怎么办？Seurat Weekly NO.0 || 开刊词[https://www.jianshu.com/p/6f88d3df702b] Seurat...
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Seurat对象中NicheNet分析以及circos可视化在这篇短文中，您可以学习如何在Seurat v3对象上执行基本的NicheNet分析，以及如何在circos图中可视化输出。值得注意的是，我们作...
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