半路出家自学的生信,研一做过一年实验,然后主要做数据分析。目前研究方向为表观遗传修饰。主要工作为分析转录组测序数据及相关二代高通量测序数据。学习新的东西是艰难的,但感觉是快乐的,加油,生信人!
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2022-03-26Cellphonedb 安装记录（Linux） 1.首先在conda base环境中安装R:conda install R(mamba install R); 2.然后创建c...
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GEO数据分析中exprs提取表达矩阵，pData提取临床信息
关于用getGEO下载数据后，会得到一个list，取出第一个列表中的元素后，再查看这第一个元素的数据类型后，发现他是一个对象（"ExpressionSet"），然后我们就会用...
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那么使用dna_rm或dna_sm就无法比对到重复序列（repeat elements）是吗？以前没有注意过这个问题，都是在UCSC或GENECODE里面直接下载基因组文件去比对重复序列
横看成岭侧成峰，基因组文件有啥不同？
刘小泽写于19.12.28我又回来啦！在马来西亚疯狂放松一周，体验了当地的风土人情。回来继续学习~感觉活力满满 这一篇的目的是：以果蝇为例，探索Ensembl数据库关于物种基...
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Seurat的打分函数AddMouduleScore在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的AddMouduleScore函数...
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单细胞实战2: Seurat+SingleR--从矩阵到细胞类型注释单细胞数据标准分析Seurat流程： Seurat官网：https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...
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wget下载GEO数据
问题描述：使用wget下载GEO数据_weixin_43551076的博客-CSDN博客[https://blog.csdn.net/weixin_43551076/arti...
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10x Genomics RNA-seq 原理详解近期的一系列际遇都再次论证了我真的是一个靠运气闯荡江湖的人，鬼使神差的混入了一个超棒的实验室，并且受到了同伴和室友在工作和生活上的无私的照顾。日子像梦一样美好，我只想时间走的...
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生活不易 我用python 请提交关于python 语言相关的内容，本专题目前不再接受关于各种库的安装问题
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