Introduction ANI 是指平均核苷酸一致性(Average Nucleotide Identity),它是一种用来比较两种基因组之间相似度的方法。ANI 主要用于...
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大家经常在文献中看到非常漂亮的多序列比对图,上面标注了各种蛋白二级结构的信息,现在小白将目前见过的最好看的序列比对图和蛋白二级结构的组合图的作图方法作分享,希望对大家的科研工...
kraken 是微生物组分析进行物种分类的工具,目前已经是第二代 kraken2 了。kraken2 对比 kraken 重点优化了数据库创建速度和数据库大小,以及分类速度。...
以下为Ginkgo_biloba.sh 的内容,用拟南芥蛋白序列blast银杏。 以下为Picea_abies.sh 的内容,用拟南芥蛋白序列blast挪威云杉。
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大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图,现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享,希望对大家的科研工作有所帮助,效果图如下: 1.在蛋白质数据、Genbank...
在处理fasta序列的时候,我们经常需要获取每一条fasta序列的长度。今天小编就跟大家来分享四种获取fasta序列长度的方法。 一、awk 输出为 二、bioawk 得到的...